logo

Genes within 1Mb (chr1:63366181:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 5.99e-06 -0.426 0.0917 0.216 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 5.08e-01 0.0661 0.0996 0.216 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 2.29e-01 0.12 0.0994 0.216 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 7.90e-01 0.0184 0.0693 0.216 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 4.81e-03 -0.308 0.108 0.216 B L1
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 1.26e-01 -0.146 0.0952 0.216 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 9.25e-01 0.0106 0.113 0.216 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.36e-02 -0.165 0.0814 0.216 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 1.86e-01 0.12 0.0904 0.216 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 2.72e-01 0.101 0.0916 0.216 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0464 0.0741 0.216 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 1.14e-01 -0.166 0.105 0.216 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 6.37e-01 0.034 0.072 0.216 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0119 0.0945 0.216 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 1.08e-01 -0.145 0.0901 0.216 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 7.96e-01 0.0258 0.0999 0.216 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 6.38e-01 0.0476 0.101 0.216 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.64e-01 0.0165 0.0961 0.216 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 2.40e-01 -0.126 0.107 0.216 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0214 0.0837 0.216 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.25e-02 0.192 0.106 0.216 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00406 0.0996 0.218 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 1.41e-01 0.151 0.102 0.218 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 7.76e-01 -0.03 0.105 0.218 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.46e-01 -0.12 0.082 0.218 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 1.82e-03 -0.355 0.112 0.218 DC L1
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0822 0.1 0.218 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 2.51e-02 -0.224 0.099 0.218 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0411 0.0982 0.216 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 2.38e-02 0.231 0.101 0.216 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 7.26e-01 0.0348 0.0991 0.216 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0467 0.0669 0.216 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 2.15e-01 -0.131 0.106 0.216 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0165 0.087 0.216 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 8.03e-02 -0.146 0.0828 0.217 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000837 0.0978 0.217 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0796 0.0804 0.217 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0679 0.0864 0.217 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0883 0.107 0.217 NK L1
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0321 0.0961 0.217 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.87e-02 0.205 0.116 0.217 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 5.92e-01 0.0505 0.0942 0.216 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 3.86e-01 0.0822 0.0946 0.216 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0706 0.0966 0.216 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0935 0.0835 0.216 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 7.14e-01 0.0272 0.0742 0.216 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 2.99e-01 0.0668 0.0642 0.216 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.14e-01 0.042 0.115 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 6.32e-02 -0.232 0.124 0.227 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 1.49e-01 -0.173 0.119 0.227 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 9.25e-01 0.0106 0.112 0.227 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0067 0.117 0.227 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0664 0.115 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 6.45e-01 0.0573 0.124 0.227 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 9.50e-02 0.181 0.108 0.227 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 6.12e-02 -0.212 0.112 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 1.54e-01 0.164 0.115 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 7.39e-01 0.0366 0.11 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.24e-01 -0.143 0.0926 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0342 0.111 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 9.72e-01 0.00393 0.111 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 9.68e-01 0.00438 0.11 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.35e-02 -0.222 0.109 0.213 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 1.51e-01 -0.161 0.112 0.213 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0324 0.105 0.213 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 4.93e-01 0.0686 0.0999 0.213 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 7.16e-02 -0.206 0.114 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 1.92e-01 0.15 0.115 0.213 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 8.84e-01 0.0166 0.114 0.213 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 1.22e-04 -0.426 0.109 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 8.73e-01 0.018 0.113 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 3.95e-01 0.0923 0.108 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.0831 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 5.97e-03 -0.302 0.109 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 2.95e-01 -0.102 0.0971 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 1.99e-01 -0.151 0.118 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.75e-03 -0.307 0.108 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 8.86e-01 0.0165 0.114 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 9.74e-01 0.00352 0.11 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 6.81e-02 0.193 0.105 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 7.99e-02 -0.2 0.114 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 3.42e-01 -0.104 0.109 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 2.89e-01 0.121 0.114 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 8.52e-01 0.0217 0.116 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0995 0.122 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0651 0.107 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.54e-01 -0.158 0.11 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0841 0.118 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0622 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0399 0.112 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 2.23e-01 -0.112 0.0917 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 5.63e-02 0.19 0.0991 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 2.86e-01 0.105 0.098 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0187 0.0868 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 2.01e-01 -0.136 0.106 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.99e-01 0.0103 0.0811 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 8.13e-01 0.0249 0.105 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 1.44e-01 -0.139 0.095 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 2.66e-01 -0.123 0.111 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 1.21e-01 0.152 0.0977 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0303 0.0957 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 3.24e-01 -0.111 0.113 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 1.61e-01 0.13 0.092 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.76e-01 -0.031 0.109 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 1.08e-02 -0.282 0.109 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00344 0.112 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00762 0.109 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0129 0.106 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0695 0.109 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0218 0.103 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.48e-01 0.0363 0.113 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0589 0.103 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 4.65e-02 0.216 0.108 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 5.48e-01 0.0622 0.103 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 2.01e-01 -0.141 0.11 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0457 0.115 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0637 0.103 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 1.21e-01 0.182 0.117 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 5.22e-03 -0.285 0.101 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 5.18e-01 0.0688 0.106 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0122 0.11 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.57e-01 0.149 0.105 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0917 0.107 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 7.18e-01 0.0327 0.0904 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0615 0.101 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 3.53e-01 -0.107 0.115 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 8.74e-02 -0.199 0.116 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 5.55e-01 0.0674 0.114 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0236 0.117 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 2.30e-01 -0.136 0.113 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 5.16e-02 0.212 0.108 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 6.78e-01 0.0481 0.116 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.43e-01 0.0903 0.117 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00149 0.118 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 5.05e-01 0.0763 0.114 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 2.18e-01 -0.135 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 4.35e-01 -0.093 0.119 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00389 0.114 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 3.10e-01 0.117 0.115 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 8.45e-01 0.0218 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 9.48e-01 0.00717 0.11 0.216 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 6.03e-01 -0.055 0.106 0.216 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0935 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 3.20e-01 -0.111 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0465 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 9.42e-01 0.00831 0.115 0.216 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 1.89e-01 -0.143 0.108 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 3.47e-01 -0.105 0.111 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0774 0.0965 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0331 0.108 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 8.59e-02 -0.193 0.112 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.08e-01 0.0281 0.116 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0405 0.111 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0731 0.087 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 7.40e-01 0.0367 0.111 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 5.75e-01 -0.054 0.0961 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 6.68e-01 0.042 0.0977 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0599 0.111 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 7.65e-01 0.0323 0.108 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 1.45e-01 0.175 0.12 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 1.91e-01 -0.156 0.119 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0182 0.123 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 4.37e-01 0.0735 0.0942 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0616 0.11 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0487 0.115 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0166 0.121 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0397 0.11 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 6.21e-01 0.0471 0.0951 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 9.28e-01 0.00974 0.108 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0117 0.0996 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 2.27e-01 -0.123 0.102 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0502 0.106 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 9.34e-02 -0.186 0.11 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 6.31e-02 0.208 0.112 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00133 0.134 0.211 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 5.24e-01 0.0899 0.141 0.211 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 1.90e-02 0.35 0.147 0.211 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.88e-01 0.0185 0.131 0.211 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0764 0.131 0.211 PB L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 1.17e-01 0.204 0.129 0.211 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 3.65e-01 -0.13 0.143 0.211 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0616 0.103 0.217 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 3.15e-01 0.106 0.105 0.217 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0254 0.105 0.217 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.19e-01 -0.144 0.0918 0.217 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 7.23e-02 0.166 0.0919 0.217 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 4.53e-01 0.0478 0.0636 0.217 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 6.52e-01 0.0485 0.108 0.217 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0572 0.108 0.216 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0491 0.116 0.216 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0775 0.106 0.216 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 5.85e-01 0.0595 0.109 0.216 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 1.22e-01 -0.176 0.113 0.216 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 2.43e-01 -0.129 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 2.50e-01 -0.125 0.109 0.216 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0711 0.107 0.227 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 6.52e-02 0.2 0.108 0.227 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0942 0.106 0.227 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.85e-01 -0.123 0.0921 0.227 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 1.10e-03 -0.378 0.114 0.227 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 1.00e+00 -4.64e-05 0.104 0.227 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0638 0.0942 0.227 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 7.07e-01 0.0384 0.102 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 4.97e-01 0.0695 0.102 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 2.97e-01 0.112 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0153 0.0759 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0464 0.107 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0212 0.0948 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0774 0.114 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 1.03e-02 0.294 0.113 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0944 0.107 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 6.11e-01 -0.047 0.0924 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 4.06e-02 -0.213 0.103 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 4.94e-01 0.0734 0.107 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0337 0.127 0.212 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 5.26e-01 0.0857 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 2.53e-01 -0.151 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0304 0.127 0.212 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 2.44e-01 0.157 0.134 0.212 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 9.95e-01 0.000806 0.127 0.212 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0611 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0452 0.114 0.22 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 8.89e-01 0.0148 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 4.92e-01 0.0747 0.109 0.22 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.37e-01 -0.154 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 8.34e-01 -0.024 0.114 0.22 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 3.86e-01 -0.101 0.116 0.22 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 2.28e-01 -0.127 0.105 0.215 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 4.99e-02 0.226 0.115 0.215 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 3.47e-01 -0.107 0.114 0.215 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 7.80e-01 0.0297 0.106 0.215 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 8.69e-01 0.0183 0.111 0.215 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 3.47e-01 -0.107 0.114 0.215 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 3.08e-01 0.125 0.122 0.218 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 3.71e-01 0.107 0.119 0.218 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 1.50e-01 0.175 0.121 0.218 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.85e-01 0.0157 0.109 0.218 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 2.03e-01 -0.156 0.122 0.218 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0344 0.125 0.218 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 1.22e-01 -0.167 0.108 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.89e-03 -0.293 0.103 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 6.92e-01 0.0461 0.116 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 4.85e-01 0.0704 0.101 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 1.93e-01 -0.106 0.0811 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 4.86e-02 -0.21 0.106 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.68e-01 0.0173 0.104 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 3.25e-01 0.11 0.111 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 1.60e-06 -0.512 0.104 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 7.01e-01 0.0433 0.113 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 5.29e-01 0.0663 0.105 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 8.12e-01 0.0191 0.0803 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 1.24e-03 -0.363 0.111 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 1.72e-01 -0.133 0.0971 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0728 0.114 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 9.75e-01 0.0033 0.105 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 2.28e-02 0.23 0.1 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 7.01e-01 0.0392 0.102 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0389 0.0706 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 1.68e-01 -0.144 0.104 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 8.47e-01 0.0172 0.0893 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0789 0.0994 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 1.33e-01 0.17 0.112 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 5.35e-01 0.0695 0.112 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0775 0.0952 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 4.47e-01 0.0843 0.111 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0658 0.104 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -227230 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0871 0.0849 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -1394 sc-eQTL 9.51e-01 0.00632 0.102 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 677795 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0622 0.0915 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 582049 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0869 0.0912 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0681 0.108 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 929884 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0918 0.0981 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -157191 sc-eQTL 6.92e-02 0.217 0.119 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -227230 eQTL 1.26e-12 -0.15 0.0209 0.0 0.0 0.215
ENSG00000088035 ALG6 -1394 eQTL 0.00458 0.045 0.0158 0.0 0.0 0.215
ENSG00000116641 DOCK7 677813 eQTL 0.00184 0.0824 0.0264 0.00416 0.00122 0.215
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 eQTL 2.73e-35 -0.419 0.0324 0.0 0.0 0.215
ENSG00000185483 ROR1 -407836 pQTL 0.0305 -0.0348 0.0161 0.0 0.0 0.218

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -227230 1.43e-06 1.47e-06 2.28e-07 1.28e-06 2.79e-07 6.09e-07 1.49e-06 3.63e-07 1.51e-06 4.82e-07 1.99e-06 6.36e-07 2.61e-06 4.3e-07 5.35e-07 9.07e-07 9.77e-07 8.55e-07 6.56e-07 5.21e-07 7.41e-07 1.92e-06 1.04e-06 6.2e-07 2.43e-06 6.58e-07 9.62e-07 1.08e-06 1.48e-06 1.25e-06 8.13e-07 1.59e-07 3.49e-07 7.04e-07 5.28e-07 4.37e-07 6.22e-07 1.7e-07 2.92e-07 6.46e-08 2.77e-07 2.04e-06 2.33e-07 1.31e-07 1.61e-07 2.36e-07 2.43e-07 8.93e-08 1.08e-07
ENSG00000088035 ALG6 -1394 0.000183 0.000242 5.22e-05 0.000113 8.45e-05 0.000109 0.000301 7.47e-05 0.000307 0.00018 0.000376 0.000158 0.000396 0.000138 7.44e-05 0.000212 0.000142 0.000221 8.61e-05 7.84e-05 0.000183 0.000291 0.000259 8.9e-05 0.000334 0.000121 0.000167 0.00015 0.000244 0.000126 0.000196 3.2e-05 3.88e-05 7.11e-05 8.45e-05 5.65e-05 3.69e-05 3.94e-05 5.88e-05 3.72e-05 2.24e-05 0.000232 3.61e-05 5.97e-06 4.36e-05 5.34e-05 4.92e-05 3.64e-05 2.53e-05
ENSG00000142856 ITGB3BP -227540 1.43e-06 1.47e-06 2.28e-07 1.28e-06 2.79e-07 6.06e-07 1.52e-06 3.63e-07 1.5e-06 4.78e-07 2.02e-06 6.36e-07 2.61e-06 4.13e-07 5.35e-07 9.07e-07 9.57e-07 8.27e-07 6.56e-07 5.21e-07 7.41e-07 1.91e-06 9.97e-07 6.28e-07 2.43e-06 6.52e-07 9.62e-07 1.08e-06 1.48e-06 1.23e-06 8.13e-07 1.59e-07 3.49e-07 6.76e-07 5.28e-07 4.37e-07 6.22e-07 1.7e-07 2.9e-07 6.46e-08 2.77e-07 2.04e-06 2.33e-07 1.31e-07 1.61e-07 2.35e-07 2.43e-07 8.93e-08 1.08e-07