logo

Genes within 1Mb (chr1:63353290:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 8.56e-05 -0.394 0.0985 0.197 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 7.67e-01 0.0314 0.106 0.197 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 1.83e-01 0.141 0.105 0.197 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 5.76e-01 0.0412 0.0735 0.197 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 1.34e-03 -0.371 0.114 0.197 B L1
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 8.10e-02 -0.177 0.101 0.197 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 9.30e-01 0.0105 0.12 0.197 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 1.74e-02 -0.207 0.0864 0.197 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 4.82e-01 0.068 0.0965 0.197 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.33e-01 0.0948 0.0976 0.197 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 7.04e-01 -0.03 0.0789 0.197 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 2.43e-01 -0.131 0.112 0.197 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 6.68e-01 0.0329 0.0766 0.197 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0439 0.101 0.197 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.96e-02 -0.19 0.096 0.197 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 9.38e-01 0.00836 0.107 0.197 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 6.86e-01 0.0438 0.108 0.197 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 6.29e-01 0.0497 0.103 0.197 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 1.15e-01 -0.181 0.114 0.197 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0762 0.0893 0.197 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 3.90e-02 0.236 0.113 0.197 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0409 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 2.09e-01 0.136 0.108 0.198 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0547 0.111 0.198 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 2.93e-01 -0.091 0.0864 0.198 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.98e-04 -0.401 0.118 0.198 DC L1
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0811 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 1.05e-01 -0.17 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0462 0.104 0.197 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 8.62e-02 0.186 0.108 0.197 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.33e-01 0.0223 0.105 0.197 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 3.98e-01 -0.06 0.0709 0.197 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 3.04e-01 -0.115 0.112 0.197 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.63e-01 0.00432 0.0922 0.197 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 1.94e-01 -0.114 0.0878 0.197 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 7.39e-01 0.0345 0.103 0.197 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0849 0.0849 0.197 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0426 0.0914 0.197 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0628 0.114 0.197 NK L1
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0623 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 2.13e-01 0.154 0.123 0.197 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 3.60e-01 0.092 0.1 0.197 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 4.33e-01 0.0792 0.101 0.197 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0644 0.103 0.197 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0448 0.0892 0.197 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.30e-01 0.0273 0.0791 0.197 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 5.48e-01 0.0412 0.0685 0.197 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 4.80e-01 0.0863 0.122 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 9.52e-02 -0.219 0.131 0.209 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 8.58e-02 -0.216 0.125 0.209 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 4.78e-01 0.0833 0.117 0.209 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000189 0.123 0.209 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0548 0.121 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 5.84e-01 0.0716 0.131 0.209 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 2.55e-01 0.13 0.114 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 3.79e-02 -0.248 0.119 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 1.60e-01 0.171 0.121 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 2.81e-01 0.125 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 1.93e-01 -0.128 0.0979 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 2.33e-01 -0.14 0.117 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.60e-01 0.00586 0.117 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00103 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.85e-02 -0.212 0.116 0.194 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 1.06e-01 -0.191 0.118 0.194 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0181 0.111 0.194 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 8.20e-01 0.0241 0.106 0.194 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 3.91e-02 -0.248 0.12 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 3.36e-01 0.117 0.122 0.194 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 6.43e-01 0.0557 0.12 0.194 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 2.49e-04 -0.432 0.116 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0565 0.12 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 5.00e-01 0.0778 0.115 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0711 0.0886 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 5.71e-03 -0.323 0.116 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.40e-02 -0.173 0.103 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 1.61e-01 -0.176 0.125 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.22e-02 -0.235 0.115 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 6.68e-01 0.0519 0.121 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0156 0.116 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 8.03e-02 0.195 0.111 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.47e-02 -0.216 0.121 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0304 0.116 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 2.20e-01 0.148 0.12 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0755 0.123 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 7.14e-02 -0.233 0.129 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 5.85e-01 -0.062 0.113 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 1.26e-01 -0.179 0.117 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0835 0.125 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 2.64e-01 -0.133 0.119 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0222 0.119 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 1.56e-01 -0.139 0.0973 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 2.75e-01 0.116 0.106 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 4.01e-01 0.0878 0.104 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00165 0.0923 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0909 0.113 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0189 0.0862 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0221 0.112 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 1.59e-01 -0.143 0.101 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.118 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.92e-02 0.215 0.104 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 8.29e-01 -0.022 0.102 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.02e-01 -0.046 0.12 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 1.67e-01 0.136 0.0982 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0287 0.116 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 1.68e-02 -0.279 0.116 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0983 0.118 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.55e-01 0.021 0.115 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 7.23e-01 0.0396 0.112 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0886 0.115 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 7.24e-01 0.0385 0.109 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0398 0.119 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 2.04e-01 -0.138 0.109 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 1.19e-01 0.18 0.115 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 7.38e-01 0.0368 0.11 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 3.79e-01 -0.103 0.117 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0755 0.122 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0726 0.109 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 8.89e-02 0.212 0.124 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 1.55e-02 -0.262 0.107 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 5.47e-01 0.068 0.113 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.45e-01 0.0228 0.117 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 6.27e-02 0.208 0.111 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 1.99e-01 -0.145 0.113 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 8.89e-01 0.0134 0.0959 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0672 0.107 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 2.40e-01 -0.144 0.122 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 1.74e-01 -0.169 0.124 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 2.56e-01 0.138 0.121 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 4.32e-01 0.0976 0.124 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 2.49e-01 -0.139 0.12 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 3.35e-01 0.112 0.116 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 3.17e-01 0.123 0.123 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 5.28e-01 0.0788 0.124 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 9.29e-01 0.0111 0.125 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.36e-01 0.117 0.121 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 8.84e-02 -0.198 0.116 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0979 0.126 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00366 0.12 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 3.25e-01 0.121 0.122 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 2.71e-01 0.13 0.118 0.197 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 9.00e-01 0.0148 0.117 0.197 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0586 0.112 0.197 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0295 0.118 0.197 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0715 0.119 0.197 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00734 0.118 0.197 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 6.11e-01 0.0622 0.122 0.197 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0537 0.115 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0998 0.118 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.02e-01 -0.106 0.102 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 3.02e-01 -0.118 0.114 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0918 0.119 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.01e-01 0.0153 0.123 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0376 0.117 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0677 0.0919 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 6.28e-01 0.0566 0.117 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0445 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 2.43e-01 0.12 0.103 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0203 0.117 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0252 0.114 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 3.78e-01 0.112 0.127 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0961 0.126 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 9.92e-01 0.00139 0.131 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 7.37e-01 0.0337 0.1 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 3.20e-01 -0.116 0.117 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0386 0.123 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000294 0.128 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0487 0.117 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.38e-01 0.0473 0.1 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 8.46e-01 0.0221 0.114 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 7.82e-01 0.0291 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0833 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 6.35e-01 -0.053 0.111 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 1.26e-01 -0.179 0.117 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 6.51e-02 0.218 0.118 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.70e-01 0.0585 0.137 0.204 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 8.37e-01 0.0297 0.144 0.204 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.10e-02 0.329 0.151 0.204 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0157 0.134 0.204 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0467 0.134 0.204 PB L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 1.73e-01 0.182 0.132 0.204 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0871 0.147 0.204 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0691 0.11 0.198 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 3.26e-01 0.11 0.111 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0165 0.112 0.198 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0678 0.0979 0.198 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 6.19e-02 0.183 0.0975 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 8.39e-01 0.0138 0.0676 0.198 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.114 0.198 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0571 0.115 0.197 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 9.75e-01 0.00382 0.123 0.197 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0721 0.112 0.197 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 7.23e-01 0.0408 0.115 0.197 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 1.01e-01 -0.197 0.119 0.197 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 3.43e-01 -0.11 0.116 0.197 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 3.32e-01 -0.112 0.115 0.197 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 3.66e-01 -0.103 0.113 0.205 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 1.48e-01 0.166 0.115 0.205 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.37e-01 -0.109 0.113 0.205 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 2.35e-01 -0.116 0.0978 0.205 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.07e-04 -0.416 0.121 0.205 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 6.55e-01 0.0496 0.111 0.205 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0291 0.1 0.205 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00383 0.108 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 5.07e-01 0.0721 0.108 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 4.78e-01 0.0811 0.114 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0185 0.0804 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0328 0.114 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00533 0.1 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0655 0.12 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 3.24e-02 0.26 0.121 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 5.24e-01 -0.072 0.113 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0562 0.0977 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 6.86e-02 -0.2 0.109 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 2.29e-01 0.137 0.113 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00827 0.136 0.191 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 5.86e-01 0.0792 0.145 0.191 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0841 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00171 0.136 0.191 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 2.89e-01 0.153 0.144 0.191 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0382 0.137 0.191 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 4.01e-01 -0.12 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0548 0.121 0.2 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0314 0.113 0.2 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 6.87e-01 0.0466 0.115 0.2 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 2.06e-01 -0.139 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0323 0.121 0.2 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 3.14e-01 -0.124 0.123 0.2 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0779 0.112 0.197 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 1.54e-01 0.175 0.122 0.197 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 3.96e-01 -0.102 0.121 0.197 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 9.82e-01 0.00256 0.113 0.197 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 6.56e-01 0.0526 0.118 0.197 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 3.05e-01 -0.124 0.12 0.197 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 8.04e-01 0.0323 0.13 0.198 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 3.41e-01 0.121 0.126 0.198 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 9.02e-02 0.219 0.128 0.198 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 5.10e-01 0.0766 0.116 0.198 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 1.81e-01 -0.174 0.13 0.198 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0818 0.133 0.198 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 2.84e-01 -0.124 0.115 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.90e-03 -0.31 0.109 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 8.97e-01 0.0159 0.123 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 1.66e-01 0.147 0.106 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 1.91e-01 -0.113 0.0857 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 9.84e-03 -0.29 0.111 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000285 0.11 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 3.83e-01 0.103 0.118 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.10e-05 -0.466 0.111 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 8.78e-01 0.0182 0.119 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.09e-01 0.0269 0.111 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 5.08e-01 0.0562 0.0848 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 7.36e-04 -0.4 0.117 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 1.80e-01 -0.138 0.103 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0828 0.12 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0162 0.111 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 5.17e-02 0.208 0.106 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 7.35e-01 0.0367 0.108 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0444 0.0747 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 2.22e-01 -0.135 0.11 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 5.16e-01 0.0614 0.0944 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0463 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 3.23e-01 0.118 0.12 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0933 0.101 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 3.55e-01 0.109 0.117 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 2.26e-01 -0.133 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -240121 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0675 0.0898 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -14285 sc-eQTL 6.84e-01 0.0441 0.108 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 664904 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0617 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 569158 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0437 0.0965 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0565 0.114 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 916993 sc-eQTL 2.66e-01 -0.116 0.104 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -170082 sc-eQTL 1.98e-01 0.163 0.126 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -240121 eQTL 6.36e-10 -0.131 0.0209 0.0 0.0 0.211
ENSG00000088035 ALG6 -14285 eQTL 0.018 0.0374 0.0158 0.0 0.0 0.211
ENSG00000116641 DOCK7 664922 eQTL 0.0065 0.0718 0.0263 0.00111 0.0 0.211
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 eQTL 8.46e-34 -0.408 0.0324 0.0 0.0 0.211
ENSG00000185483 ROR1 -420727 pQTL 0.0417 -0.0328 0.0161 0.0 0.0 0.212

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -240121 1.43e-06 1.31e-06 2.83e-07 1.32e-06 3.96e-07 5.91e-07 1.53e-06 3.65e-07 1.51e-06 5.9e-07 2.06e-06 8.77e-07 2.55e-06 3.07e-07 5.01e-07 9.19e-07 1.01e-06 8.82e-07 8.04e-07 4.81e-07 7.96e-07 1.82e-06 9.91e-07 5.17e-07 2.38e-06 6.01e-07 9.37e-07 9.43e-07 1.48e-06 1.27e-06 8.57e-07 2.86e-07 2.64e-07 6.61e-07 5.69e-07 4.32e-07 6.81e-07 3.1e-07 4.99e-07 3.13e-07 2.88e-07 1.62e-06 1.94e-07 1.31e-07 3.12e-07 2.32e-07 2.16e-07 1.43e-07 1.93e-07
ENSG00000088035 ALG6 -14285 2.1e-05 2.48e-05 4.32e-06 1.3e-05 3.7e-06 1e-05 3.09e-05 3.69e-06 2.05e-05 1.04e-05 2.74e-05 1.07e-05 3.72e-05 9.56e-06 5.5e-06 1.18e-05 1.22e-05 1.83e-05 6.31e-06 5.38e-06 1.02e-05 2.26e-05 2.27e-05 7.45e-06 3.32e-05 5.95e-06 8.66e-06 8.92e-06 2.25e-05 2.23e-05 1.39e-05 1.65e-06 2.23e-06 5.81e-06 9.06e-06 4.58e-06 2.65e-06 2.97e-06 3.98e-06 2.9e-06 1.66e-06 2.81e-05 2.68e-06 3.33e-07 2e-06 2.96e-06 3.42e-06 1.53e-06 1.39e-06
ENSG00000142856 ITGB3BP -240431 1.42e-06 1.31e-06 2.95e-07 1.32e-06 3.96e-07 5.91e-07 1.53e-06 3.65e-07 1.5e-06 5.86e-07 2.06e-06 8.77e-07 2.5e-06 2.82e-07 4.98e-07 9.19e-07 1.02e-06 8.82e-07 8.04e-07 4.81e-07 7.96e-07 1.82e-06 9.91e-07 5.57e-07 2.38e-06 6.01e-07 9.37e-07 9.43e-07 1.48e-06 1.23e-06 8.51e-07 2.86e-07 2.64e-07 6.61e-07 5.67e-07 4.3e-07 6.66e-07 3.1e-07 4.97e-07 3.13e-07 2.88e-07 1.63e-06 1.93e-07 1.31e-07 3.12e-07 2.32e-07 2.15e-07 1.43e-07 1.83e-07