logo

Genes within 1Mb (chr1:63350770:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 3.03e-02 0.192 0.0879 0.261 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 7.25e-01 0.0325 0.0921 0.261 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0782 0.092 0.261 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 8.28e-01 0.014 0.064 0.261 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 6.02e-10 0.604 0.093 0.261 B L1
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0429 0.0884 0.261 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 1.02e-01 0.171 0.104 0.261 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 1.70e-01 0.103 0.0747 0.261 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 8.95e-02 -0.14 0.0823 0.261 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0318 0.0839 0.261 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 9.58e-01 0.00356 0.0677 0.261 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 8.49e-11 0.595 0.087 0.261 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 4.11e-01 0.0541 0.0656 0.261 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 2.43e-03 0.259 0.0844 0.261 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 5.37e-02 0.159 0.0821 0.261 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 1.95e-01 0.118 0.0909 0.261 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 1.85e-01 -0.122 0.0921 0.261 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 8.85e-01 0.0127 0.0879 0.261 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.27e-08 0.525 0.0914 0.261 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0223 0.0765 0.261 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 6.95e-03 0.262 0.0963 0.261 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 6.47e-01 0.0429 0.0934 0.257 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 1.47e-01 -0.14 0.0959 0.257 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0557 0.0988 0.257 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 2.73e-01 0.0848 0.0771 0.257 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 5.78e-02 0.204 0.107 0.257 DC L1
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.41e-01 0.111 0.0941 0.257 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 1.80e-02 0.221 0.0928 0.257 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 5.01e-01 0.0608 0.0903 0.261 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 1.95e-02 -0.219 0.0931 0.261 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.59e-01 0.028 0.0912 0.261 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0214 0.0616 0.261 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 7.56e-08 0.507 0.0909 0.261 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.08e-02 0.184 0.079 0.261 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0366 0.0762 0.262 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0198 0.0893 0.262 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0574 0.0735 0.262 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 6.14e-01 0.0399 0.079 0.262 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 2.81e-04 0.352 0.0952 0.262 NK L1
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 1.59e-01 0.124 0.0874 0.262 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 6.78e-01 0.0443 0.107 0.262 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0379 0.0871 0.261 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0324 0.0876 0.261 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.21e-02 -0.16 0.0887 0.261 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00824 0.0774 0.261 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 2.49e-01 0.0791 0.0684 0.261 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0649 0.0593 0.261 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.106 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 9.13e-01 0.0128 0.118 0.24 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0536 0.113 0.24 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00977 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 3.13e-01 -0.111 0.11 0.24 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.62e-03 0.311 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0569 0.117 0.24 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 9.82e-01 0.00226 0.102 0.24 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 8.63e-01 0.0179 0.104 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 5.30e-01 0.0665 0.106 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000694 0.101 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 5.17e-01 0.0554 0.0855 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 7.77e-03 0.269 0.1 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.44e-01 -0.047 0.102 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 3.83e-02 0.208 0.0999 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 1.69e-01 0.141 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 6.64e-01 0.0452 0.104 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 3.96e-01 0.0829 0.0974 0.263 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0491 0.0927 0.263 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.23e-02 0.264 0.105 0.263 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0974 0.107 0.263 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 4.07e-01 0.0874 0.105 0.263 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 6.87e-02 0.19 0.104 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 3.19e-01 0.105 0.105 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0283 0.101 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 1.41e-01 0.114 0.0772 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.62e-07 0.523 0.0964 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 8.08e-01 -0.022 0.0905 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 2.03e-02 0.254 0.108 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 1.63e-02 0.245 0.101 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0524 0.107 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 8.55e-01 0.0187 0.103 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0289 0.0988 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 7.74e-07 0.515 0.101 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0782 0.102 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 5.39e-02 -0.205 0.106 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 2.76e-01 -0.115 0.105 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0414 0.112 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000987 0.0976 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 1.69e-01 -0.139 0.1 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 2.03e-01 0.137 0.108 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 8.87e-02 0.175 0.102 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0126 0.103 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 2.99e-01 0.0876 0.0842 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 3.66e-02 -0.191 0.0907 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0487 0.09 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 8.81e-01 0.0119 0.0796 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.78e-09 0.562 0.0893 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00707 0.0743 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 9.64e-02 0.16 0.096 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0869 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 3.12e-01 0.102 0.101 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.42e-01 0.0296 0.0897 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.46e-02 0.155 0.0867 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.07e-05 0.443 0.0983 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.76e-01 0.0919 0.0842 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 1.14e-04 0.378 0.0962 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 3.89e-01 0.0882 0.102 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0374 0.103 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.53e-01 0.0316 0.1 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 1.74e-01 -0.132 0.097 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 4.63e-03 0.282 0.0986 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.88e-01 0.101 0.095 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 5.49e-01 0.0625 0.104 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 6.14e-01 0.0479 0.0948 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 9.68e-01 0.00408 0.101 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0465 0.0957 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 2.63e-01 -0.114 0.102 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 2.78e-02 0.232 0.105 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0331 0.0949 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 3.35e-01 0.105 0.108 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 2.02e-02 0.221 0.0945 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 7.28e-01 0.0345 0.099 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0364 0.102 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 3.23e-01 0.0972 0.0981 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.57e-06 0.466 0.0943 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 9.81e-01 -0.002 0.0842 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 3.67e-02 0.195 0.0929 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 5.41e-01 0.0645 0.105 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 6.68e-02 0.195 0.106 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 3.14e-01 -0.105 0.104 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 2.29e-01 0.128 0.106 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.65e-03 0.321 0.101 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.67e-01 0.0428 0.0994 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 2.11e-01 0.132 0.105 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 7.30e-01 0.0374 0.108 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 7.47e-01 0.0351 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 1.53e-01 -0.15 0.105 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 6.11e-01 0.0515 0.101 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 9.86e-02 0.181 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.68e-01 -0.116 0.104 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 7.87e-01 0.0287 0.106 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0817 0.101 0.264 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 3.76e-01 0.0891 0.1 0.264 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 9.87e-02 -0.159 0.0958 0.264 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 9.92e-01 0.000995 0.102 0.264 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 5.01e-03 0.283 0.0999 0.264 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 7.15e-01 -0.037 0.101 0.264 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0102 0.105 0.264 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 3.75e-01 0.0899 0.101 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0989 0.104 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0247 0.09 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 1.04e-01 0.163 0.0999 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 6.27e-03 0.284 0.103 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.64e-01 0.121 0.108 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 7.16e-02 0.186 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 1.56e-01 -0.113 0.0792 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 8.18e-01 0.0232 0.101 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0951 0.0876 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.42e-01 0.0294 0.0892 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.65e-01 0.141 0.101 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 3.40e-01 0.094 0.0982 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0697 0.11 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 1.90e-02 0.262 0.111 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0503 0.117 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 1.14e-01 -0.141 0.0887 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0333 0.104 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.87e-01 0.144 0.108 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.74e-01 -0.048 0.114 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 2.53e-01 0.119 0.103 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 1.90e-01 -0.114 0.0868 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0344 0.0985 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0525 0.0912 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 9.16e-01 0.00982 0.0934 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.70e-04 0.358 0.0935 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 4.79e-01 0.072 0.102 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 5.03e-01 -0.069 0.103 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 6.94e-02 0.236 0.129 0.233 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0981 0.137 0.233 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 1.19e-01 -0.228 0.145 0.233 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 2.92e-01 -0.135 0.127 0.233 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 4.34e-01 0.1 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 3.68e-01 -0.115 0.127 0.233 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 1.84e-01 0.186 0.139 0.233 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0115 0.0948 0.263 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 3.68e-02 -0.201 0.0955 0.263 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 1.37e-01 0.144 0.0963 0.263 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 4.86e-02 0.167 0.0839 0.263 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.05e-03 -0.25 0.0832 0.263 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0557 0.0583 0.263 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0541 0.0987 0.263 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0338 0.1 0.261 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0262 0.107 0.261 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0572 0.0981 0.261 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0724 0.1 0.261 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 6.17e-03 0.285 0.103 0.261 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0469 0.102 0.261 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 2.78e-02 0.22 0.0993 0.261 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 3.92e-01 0.0862 0.101 0.251 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00895 0.102 0.251 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0313 0.1 0.251 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 5.38e-01 0.0536 0.087 0.251 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 2.61e-01 0.124 0.11 0.251 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 3.48e-01 0.0922 0.098 0.251 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 8.17e-02 0.154 0.0879 0.251 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 2.90e-01 0.099 0.0934 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0624 0.0936 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0145 0.0988 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0189 0.0695 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.12e-05 0.402 0.0945 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 3.80e-01 0.0762 0.0867 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.104 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 6.53e-02 -0.194 0.104 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0399 0.0976 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0115 0.0845 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 6.03e-05 0.376 0.0918 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 1.22e-01 0.152 0.0976 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0704 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 3.69e-01 0.106 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 3.51e-01 -0.108 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0419 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 8.26e-01 0.0258 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 5.21e-01 0.0712 0.111 0.273 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0618 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 9.42e-01 0.0072 0.098 0.256 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 7.75e-01 0.0287 0.1 0.256 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0474 0.0955 0.256 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.89e-02 0.217 0.104 0.256 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 1.14e-01 0.169 0.106 0.256 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0961 0.26 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 2.15e-02 -0.243 0.105 0.26 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 3.00e-01 0.108 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 6.49e-01 0.0444 0.0974 0.26 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.16e-01 0.102 0.102 0.26 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.92e-01 0.11 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 3.31e-01 -0.114 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 2.11e-01 -0.143 0.114 0.263 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 2.98e-01 -0.122 0.116 0.263 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.105 0.263 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 1.07e-01 0.189 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0626 0.12 0.263 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 3.54e-01 0.0965 0.104 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 4.23e-01 0.0778 0.0969 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 8.60e-01 0.0189 0.107 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 8.26e-01 0.0205 0.0932 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.34e-01 0.0256 0.0753 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 6.41e-05 0.389 0.0953 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0446 0.096 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 3.12e-02 0.221 0.102 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 3.03e-03 0.299 0.0996 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 8.15e-01 0.0245 0.105 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 9.53e-01 0.00578 0.0978 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 4.70e-01 0.0539 0.0745 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.86e-10 0.632 0.0961 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 5.37e-01 -0.056 0.0906 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.106 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 8.65e-01 0.0163 0.0955 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 5.70e-02 -0.175 0.0917 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0198 0.0931 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0122 0.0644 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 4.00e-07 0.469 0.0896 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 4.66e-02 0.161 0.0806 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 5.87e-01 0.05 0.0919 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 1.14e-01 -0.165 0.104 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 6.30e-01 0.0498 0.103 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 9.81e-01 0.00207 0.0881 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 3.25e-02 0.218 0.101 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 4.73e-02 0.19 0.0952 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -242641 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0474 0.0774 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -16805 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.093 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 662384 sc-eQTL 2.04e-01 -0.106 0.083 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 566638 sc-eQTL 7.01e-01 0.032 0.0832 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 sc-eQTL 9.40e-04 0.322 0.096 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 914473 sc-eQTL 2.04e-01 0.114 0.0892 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -172602 sc-eQTL 9.55e-01 0.00614 0.109 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -16805 eQTL 1.44e-10 -0.0969 0.0149 0.0 0.00368 0.239
ENSG00000125703 ATG4C 566638 eQTL 0.0241 -0.0436 0.0193 0.0 0.0 0.239
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 eQTL 2.98e-20 0.304 0.0323 0.0 0.0 0.239
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 26329 eQTL 0.0452 -0.0601 0.03 0.0 0.0 0.239

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 ALG6 -16805 2.13e-05 2.37e-05 5.06e-06 1.35e-05 5.1e-06 1.27e-05 3.43e-05 3.87e-06 2.29e-05 1.2e-05 3.02e-05 1.21e-05 3.98e-05 1.06e-05 5.99e-06 1.37e-05 1.31e-05 2.03e-05 7.46e-06 6.57e-06 1.27e-05 2.46e-05 2.45e-05 8.82e-06 3.7e-05 6.74e-06 1.05e-05 1.02e-05 2.69e-05 2.67e-05 1.5e-05 1.64e-06 2.68e-06 7.33e-06 1.01e-05 5.77e-06 3.46e-06 3.16e-06 5.08e-06 3.57e-06 1.77e-06 2.87e-05 2.75e-06 4.67e-07 2.49e-06 3.65e-06 3.88e-06 1.69e-06 1.51e-06
ENSG00000125703 ATG4C 566638 5.37e-07 3.11e-07 8.55e-08 2.66e-07 1.06e-07 1.5e-07 4.09e-07 8.17e-08 2.66e-07 1.7e-07 3.92e-07 2.28e-07 4.54e-07 9.48e-08 1.32e-07 1.53e-07 1.18e-07 3.02e-07 1.5e-07 8.41e-08 1.61e-07 2.51e-07 2.63e-07 9.01e-08 4.67e-07 2.2e-07 1.87e-07 2.01e-07 2.31e-07 2.59e-07 1.93e-07 7.4e-08 6.08e-08 1.24e-07 1.67e-07 5.32e-08 8.07e-08 6.31e-08 5.98e-08 6.07e-08 4.78e-08 3.26e-07 3.09e-08 1.97e-08 9.95e-08 1.35e-08 1.03e-07 2.94e-09 5.61e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -242951 1.39e-06 1.47e-06 2.87e-07 1.23e-06 4.72e-07 6.38e-07 1.19e-06 4.13e-07 1.73e-06 6.98e-07 1.98e-06 9.49e-07 2.7e-06 4.13e-07 4.05e-07 9.95e-07 1e-06 1.1e-06 5.86e-07 4.58e-07 6.58e-07 1.97e-06 1.34e-06 6.2e-07 2.37e-06 8.11e-07 9.78e-07 9.87e-07 1.64e-06 1.31e-06 8.46e-07 2.42e-07 3.45e-07 5.53e-07 5.91e-07 5.32e-07 7.4e-07 3.63e-07 5.18e-07 2.31e-07 3.59e-07 2.12e-06 1.94e-07 2.07e-07 3.65e-07 2.74e-07 2.69e-07 1.39e-07 2.57e-07