logo

Genes within 1Mb (chr1:63346598:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 4.69e-02 0.176 0.0881 0.263 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 8.27e-01 0.0201 0.0921 0.263 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0842 0.0919 0.263 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 7.79e-01 0.018 0.064 0.263 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 4.53e-10 0.608 0.0929 0.263 B L1
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0428 0.0884 0.263 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 1.10e-01 0.166 0.104 0.263 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 8.53e-02 0.129 0.0744 0.263 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 1.07e-01 -0.133 0.0822 0.263 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0145 0.0837 0.263 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 7.19e-01 0.0243 0.0676 0.263 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.36e-10 0.588 0.087 0.263 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 4.90e-01 0.0453 0.0655 0.263 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 1.21e-03 0.276 0.084 0.263 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 5.89e-02 0.156 0.0821 0.263 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 1.82e-01 0.122 0.0909 0.263 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 1.79e-01 -0.124 0.0921 0.263 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 8.14e-01 0.0207 0.0878 0.263 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 3.57e-08 0.523 0.0914 0.263 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0133 0.0765 0.263 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 6.32e-03 0.265 0.0962 0.263 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 6.80e-01 0.0384 0.093 0.259 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 1.35e-01 -0.143 0.0955 0.259 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0542 0.0984 0.259 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 3.35e-01 0.0744 0.0769 0.259 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 4.63e-02 0.214 0.107 0.259 DC L1
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 2.11e-01 0.117 0.0937 0.259 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 2.40e-02 0.21 0.0925 0.259 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 4.14e-01 0.0737 0.09 0.263 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 2.18e-02 -0.215 0.0929 0.263 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 5.85e-01 0.0498 0.091 0.263 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00925 0.0615 0.263 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 7.04e-08 0.507 0.0907 0.263 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 1.52e-02 0.193 0.0787 0.263 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0544 0.076 0.264 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0237 0.0893 0.264 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0553 0.0734 0.264 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 6.17e-01 0.0395 0.0789 0.264 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.44e-04 0.355 0.095 0.264 NK L1
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 1.41e-01 0.129 0.0872 0.264 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 6.50e-01 0.0484 0.107 0.264 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0279 0.0875 0.263 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0336 0.0879 0.263 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 7.94e-02 -0.157 0.0891 0.263 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00363 0.0777 0.263 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.56e-01 0.0782 0.0687 0.263 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0518 0.0596 0.263 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 9.62e-01 0.00505 0.106 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.242 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0575 0.112 0.242 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0255 0.105 0.242 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 3.45e-01 -0.104 0.11 0.242 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 5.32e-03 0.297 0.105 0.242 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0735 0.116 0.242 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 8.86e-01 0.0146 0.102 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 9.87e-01 0.00173 0.104 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 5.69e-01 0.0602 0.106 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00999 0.101 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 5.19e-01 0.0551 0.0854 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 8.55e-03 0.266 0.1 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0518 0.102 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 3.27e-02 0.214 0.0998 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 2.02e-01 0.13 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 5.37e-01 0.0642 0.104 0.265 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 2.64e-01 0.109 0.0971 0.265 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 7.13e-01 -0.034 0.0925 0.265 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.23e-02 0.264 0.104 0.265 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.45e-01 -0.101 0.107 0.265 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 3.73e-01 0.0936 0.105 0.265 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 7.12e-02 0.188 0.104 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 4.20e-01 0.0847 0.105 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0399 0.101 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 1.60e-01 0.109 0.0771 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.53e-07 0.514 0.0965 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0181 0.0903 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 2.46e-02 0.245 0.108 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 2.54e-02 0.227 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0621 0.106 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 7.53e-01 0.0323 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0239 0.0986 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 4.15e-07 0.526 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0903 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 4.83e-02 -0.209 0.105 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 2.82e-01 -0.114 0.105 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0495 0.111 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.0974 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 1.39e-01 -0.149 0.1 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.49e-01 0.155 0.107 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 9.74e-02 0.17 0.102 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0172 0.102 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 2.21e-01 0.103 0.084 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 5.34e-02 -0.176 0.0908 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0368 0.09 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 7.80e-01 0.0222 0.0796 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.99e-09 0.56 0.0893 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00656 0.0743 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 5.92e-02 0.182 0.0957 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 1.67e-01 0.12 0.0866 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 3.41e-01 0.0962 0.101 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 6.10e-01 0.0457 0.0895 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 3.38e-02 0.184 0.0862 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.78e-05 0.422 0.0985 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.66e-01 0.0762 0.0841 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 9.08e-05 0.383 0.0959 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 3.08e-01 0.104 0.102 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0197 0.103 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 6.29e-01 0.0485 0.1 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 2.29e-01 -0.117 0.097 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 3.45e-03 0.291 0.0984 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.80e-01 0.0835 0.095 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 5.64e-01 0.0602 0.104 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 6.11e-01 0.0484 0.0949 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 9.66e-01 0.00428 0.101 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0448 0.0958 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 2.58e-01 -0.115 0.102 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.80e-02 0.232 0.105 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0343 0.095 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 3.40e-01 0.104 0.108 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 2.46e-02 0.214 0.0945 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 6.94e-01 0.039 0.099 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0396 0.102 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 2.85e-01 0.105 0.098 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.37e-06 0.468 0.0942 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00302 0.0841 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 3.44e-02 0.198 0.0928 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 4.85e-01 0.0736 0.105 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 9.12e-02 0.18 0.106 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 2.70e-01 -0.115 0.104 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 2.77e-01 0.116 0.106 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.27e-03 0.313 0.101 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 5.95e-01 0.0531 0.0996 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 2.03e-01 0.134 0.105 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 7.30e-01 0.0374 0.108 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 7.47e-01 0.0351 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 1.53e-01 -0.15 0.105 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 6.11e-01 0.0515 0.101 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 9.86e-02 0.181 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 2.68e-01 -0.116 0.104 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 7.87e-01 0.0287 0.106 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0856 0.101 0.266 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 3.12e-01 0.101 0.1 0.266 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 1.14e-01 -0.152 0.0955 0.266 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0208 0.101 0.266 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 4.99e-03 0.283 0.0996 0.266 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0204 0.101 0.266 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0159 0.104 0.266 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 5.62e-01 0.0587 0.101 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0878 0.104 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0148 0.0899 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 5.79e-02 0.19 0.0996 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.03e-02 0.267 0.103 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 2.91e-01 0.114 0.108 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 9.55e-02 0.172 0.103 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 1.02e-01 -0.13 0.0789 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 8.58e-01 0.018 0.101 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0845 0.0875 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 7.52e-01 0.0281 0.0891 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.47e-01 0.147 0.101 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.08e-01 0.1 0.0981 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0739 0.109 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 1.57e-02 0.269 0.111 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0289 0.116 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 9.46e-02 -0.148 0.0883 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0463 0.103 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.57e-01 0.123 0.108 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0477 0.114 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 2.78e-01 0.112 0.103 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 1.64e-01 -0.121 0.0866 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0437 0.0983 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0688 0.091 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00114 0.0932 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.19e-04 0.365 0.0931 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 4.41e-01 0.0782 0.101 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0534 0.103 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 8.69e-02 0.223 0.129 0.237 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 4.17e-01 -0.111 0.137 0.237 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 8.87e-02 -0.249 0.145 0.237 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0802 0.128 0.237 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 5.00e-01 0.0861 0.127 0.237 PB L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 2.37e-01 -0.15 0.126 0.237 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 2.43e-01 0.164 0.139 0.237 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0087 0.0951 0.265 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 3.93e-02 -0.199 0.0958 0.265 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 1.35e-01 0.145 0.0966 0.265 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 3.91e-02 0.175 0.0841 0.265 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.64e-03 -0.254 0.0834 0.265 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 4.13e-01 -0.048 0.0585 0.265 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 4.99e-01 -0.067 0.099 0.265 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0211 0.0998 0.263 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 8.00e-01 -0.027 0.107 0.263 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 5.54e-01 -0.058 0.0979 0.263 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0698 0.1 0.263 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 6.69e-03 0.282 0.103 0.263 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0522 0.101 0.263 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 2.96e-02 0.217 0.0991 0.263 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 3.87e-01 0.0867 0.1 0.254 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0118 0.102 0.254 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0297 0.0998 0.254 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 6.42e-01 0.0403 0.0866 0.254 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 2.11e-01 0.137 0.109 0.254 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.34e-01 0.0946 0.0975 0.254 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 1.01e-01 0.145 0.0876 0.254 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 2.21e-01 0.114 0.0931 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0542 0.0935 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 9.88e-01 0.00145 0.0986 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00941 0.0694 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 3.49e-05 0.399 0.0943 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 2.41e-01 0.102 0.0864 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0915 0.103 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 7.28e-02 -0.188 0.104 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0195 0.0973 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 9.98e-01 0.000174 0.0843 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 5.75e-05 0.376 0.0915 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 1.73e-01 0.133 0.0974 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0704 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 3.69e-01 0.106 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 3.51e-01 -0.108 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0419 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 8.26e-01 0.0258 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 5.21e-01 0.0712 0.111 0.273 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0644 0.105 0.258 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 9.85e-01 0.0019 0.0979 0.258 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 5.64e-01 0.0577 0.0999 0.258 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0495 0.0954 0.258 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 5.04e-02 0.205 0.104 0.258 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 1.50e-01 0.154 0.106 0.258 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0961 0.26 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 2.15e-02 -0.243 0.105 0.26 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 3.00e-01 0.108 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 6.49e-01 0.0444 0.0974 0.26 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 3.16e-01 0.102 0.102 0.26 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 2.92e-01 0.11 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 3.31e-01 -0.114 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 2.11e-01 -0.143 0.114 0.263 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 2.98e-01 -0.122 0.116 0.263 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.105 0.263 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 1.07e-01 0.189 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0626 0.12 0.263 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 3.54e-01 0.0965 0.104 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 5.24e-01 0.0618 0.0968 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 8.03e-01 0.0268 0.107 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 8.30e-01 0.02 0.093 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 6.88e-01 0.0302 0.0752 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 8.06e-05 0.383 0.0952 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0519 0.0959 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 2.31e-02 0.233 0.102 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 4.25e-03 0.288 0.0996 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 9.73e-01 0.0035 0.105 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 9.73e-01 0.00326 0.0976 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 5.12e-01 0.0489 0.0744 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 3.49e-10 0.632 0.0959 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 5.29e-01 -0.057 0.0904 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 3.53e-01 0.0983 0.106 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 7.44e-01 0.0312 0.0953 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 6.90e-02 -0.167 0.0916 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00193 0.093 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000724 0.0643 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 3.91e-07 0.469 0.0894 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 3.57e-02 0.17 0.0804 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 5.99e-01 0.0485 0.092 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 9.12e-02 -0.176 0.104 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 4.20e-01 0.0835 0.103 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00259 0.0882 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 3.42e-02 0.216 0.101 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 2.45e-02 0.215 0.0951 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -246813 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0615 0.0773 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -20977 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0171 0.0929 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 658212 sc-eQTL 2.21e-01 -0.102 0.0829 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 562466 sc-eQTL 7.28e-01 0.0289 0.0831 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 sc-eQTL 7.91e-04 0.326 0.0959 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 910301 sc-eQTL 1.70e-01 0.122 0.089 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -176774 sc-eQTL 9.06e-01 0.0129 0.109 0.263 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -20977 eQTL 1.86e-10 -0.0959 0.0149 0.0 0.00317 0.238
ENSG00000125703 ATG4C 562466 eQTL 0.0257 -0.0429 0.0192 0.0 0.0 0.238
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 eQTL 5.04e-20 0.301 0.0321 0.0 0.0 0.238
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 22157 eQTL 0.0382 -0.0619 0.0298 0.0 0.0 0.238

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 ALG6 -20977 1.65e-05 2.26e-05 4.04e-06 1.27e-05 3.6e-06 9.68e-06 2.95e-05 3.67e-06 1.97e-05 1.09e-05 2.63e-05 9.87e-06 3.66e-05 9.13e-06 5.53e-06 1.14e-05 1.05e-05 1.62e-05 6.31e-06 5.07e-06 9.55e-06 2.11e-05 2.05e-05 6.56e-06 3.2e-05 5.31e-06 8.84e-06 8.88e-06 2.33e-05 1.97e-05 1.31e-05 1.41e-06 1.92e-06 5.42e-06 8.98e-06 4.55e-06 2.29e-06 2.88e-06 3.56e-06 2.77e-06 1.69e-06 2.55e-05 2.68e-06 3.43e-07 1.93e-06 2.95e-06 3.33e-06 1.43e-06 1.32e-06
ENSG00000125703 ATG4C 562466 3.27e-07 1.78e-07 6.28e-08 2.49e-07 1.07e-07 1.19e-07 2.63e-07 6.57e-08 1.86e-07 1.11e-07 2.38e-07 1.59e-07 2.55e-07 8.55e-08 9.2e-08 9.11e-08 4.25e-08 2.21e-07 7.76e-08 8.31e-08 1.26e-07 1.81e-07 1.73e-07 4.27e-08 2.48e-07 1.31e-07 1.33e-07 1.46e-07 1.37e-07 1.39e-07 1.52e-07 4.43e-08 4.16e-08 9.08e-08 6.98e-08 3.24e-08 5.26e-08 7.25e-08 6.35e-08 8.06e-08 4.53e-08 1.6e-07 3.99e-08 1.08e-08 4.36e-08 8.94e-09 7.97e-08 2.2e-09 4.68e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -247123 1.31e-06 1.3e-06 2.57e-07 1.29e-06 3.81e-07 6.42e-07 1.5e-06 4.16e-07 1.67e-06 6.61e-07 2.07e-06 9.21e-07 2.53e-06 3.31e-07 4.03e-07 9.48e-07 8.85e-07 9.52e-07 7.08e-07 4.69e-07 7.54e-07 1.92e-06 1.12e-06 5.3e-07 2.41e-06 6.01e-07 1e-06 8.64e-07 1.62e-06 1.16e-06 8.51e-07 2.53e-07 2.64e-07 6.61e-07 6.01e-07 4.74e-07 7.24e-07 2.95e-07 4.67e-07 2.43e-07 2.87e-07 1.63e-06 1.24e-07 8.96e-08 3.26e-07 3.05e-07 2.09e-07 4.85e-08 1.82e-07