logo

Genes within 1Mb (chr1:63340171:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.56e-01 0.0822 0.0889 0.274 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 7.96e-01 0.0239 0.0922 0.274 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0986 0.092 0.274 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00656 0.0641 0.274 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.85e-08 0.554 0.0947 0.274 B L1
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0532 0.0885 0.274 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 2.43e-01 0.122 0.104 0.274 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.62e-01 0.0686 0.0751 0.274 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 1.73e-01 -0.113 0.0827 0.274 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0084 0.0841 0.274 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.26e-01 0.0238 0.0679 0.274 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 6.16e-09 0.539 0.089 0.274 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.52e-01 0.0614 0.0657 0.274 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 8.81e-03 0.225 0.0851 0.274 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.64e-01 0.0753 0.0827 0.274 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 1.61e-01 0.128 0.0909 0.274 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 1.67e-01 -0.128 0.0921 0.274 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 8.02e-01 0.022 0.0879 0.274 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.00e-07 0.496 0.0922 0.274 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 9.04e-01 0.00927 0.0766 0.274 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 1.13e-02 0.247 0.0965 0.274 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 6.19e-01 0.0463 0.0931 0.268 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 1.95e-01 -0.124 0.0957 0.268 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0724 0.0984 0.268 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 4.50e-01 0.0583 0.077 0.268 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.99e-02 0.233 0.106 0.268 DC L1
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.94e-01 0.0988 0.0938 0.268 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 1.62e-02 0.224 0.0924 0.268 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 7.77e-01 0.0256 0.0905 0.274 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 1.75e-02 -0.223 0.0932 0.274 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 7.89e-01 0.0244 0.0913 0.274 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00137 0.0617 0.274 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 4.12e-07 0.48 0.0918 0.274 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.69e-02 0.176 0.0792 0.274 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 1.27e-01 -0.116 0.0757 0.273 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0568 0.0891 0.273 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0448 0.0734 0.273 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.14e-01 0.029 0.0789 0.273 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.26e-04 0.356 0.095 0.273 NK L1
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 1.33e-01 0.132 0.0872 0.273 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 7.52e-01 0.0337 0.106 0.273 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0682 0.0872 0.274 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0775 0.0876 0.274 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 3.93e-02 -0.184 0.0887 0.274 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.96e-01 -0.02 0.0775 0.274 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.89e-01 0.0729 0.0686 0.274 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0522 0.0595 0.274 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 9.56e-01 0.00584 0.106 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00171 0.117 0.255 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0559 0.112 0.255 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 9.82e-01 0.0024 0.104 0.255 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0842 0.109 0.255 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 9.57e-03 0.275 0.105 0.255 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.49e-01 -0.109 0.116 0.255 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0136 0.101 0.255 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0292 0.104 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 5.26e-01 0.067 0.105 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0127 0.101 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 5.61e-01 0.0496 0.0853 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 6.48e-03 0.275 0.0999 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0497 0.101 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 4.11e-02 0.205 0.0997 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.85e-01 0.0888 0.102 0.276 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 4.70e-01 0.075 0.104 0.276 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 3.39e-01 0.0932 0.0972 0.276 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0321 0.0925 0.276 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 3.30e-02 0.225 0.105 0.276 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0759 0.107 0.276 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 5.30e-01 0.0661 0.105 0.276 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.05e-01 0.107 0.104 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 5.40e-01 0.0643 0.105 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0792 0.1 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 3.47e-01 0.0728 0.0773 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 3.63e-06 0.464 0.0976 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0315 0.0903 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 5.73e-02 0.208 0.109 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 1.31e-01 0.154 0.101 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0398 0.106 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 7.53e-01 0.0323 0.102 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00979 0.0985 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 4.23e-06 0.479 0.101 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.76e-01 -0.111 0.101 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 4.13e-02 -0.216 0.105 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 2.46e-01 -0.122 0.105 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0531 0.111 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00927 0.0975 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 1.07e-01 -0.162 0.1 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.37e-01 0.128 0.108 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 9.94e-02 0.169 0.102 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0367 0.103 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 5.76e-01 0.0474 0.0847 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 7.54e-02 -0.163 0.0914 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0417 0.0905 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.25e-01 0.0282 0.08 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 5.39e-08 0.514 0.0912 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 8.79e-01 0.0114 0.0747 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 1.65e-01 0.135 0.0967 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 4.20e-01 0.0704 0.0871 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 2.90e-01 0.107 0.101 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 5.94e-01 0.0479 0.0897 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 3.69e-02 0.182 0.0865 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.47e-04 0.385 0.0996 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.36e-01 0.1 0.0842 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 1.79e-04 0.368 0.0965 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 4.47e-01 0.0779 0.102 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0272 0.103 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 4.89e-01 0.0695 0.1 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 1.81e-01 -0.13 0.097 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 3.18e-03 0.294 0.0985 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 6.03e-01 0.0496 0.0952 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 7.84e-01 0.0286 0.104 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00484 0.0947 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 8.81e-01 0.0151 0.101 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0354 0.0955 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 2.23e-01 -0.124 0.101 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 5.95e-02 0.199 0.105 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 9.67e-01 0.00388 0.0947 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 2.01e-01 0.138 0.108 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 1.15e-01 0.151 0.0953 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 6.98e-01 0.0385 0.0992 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0625 0.103 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 2.67e-01 0.109 0.0982 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.49e-06 0.458 0.0946 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 9.55e-01 0.00479 0.0843 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 3.54e-02 0.197 0.0931 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 7.11e-01 0.0393 0.106 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 6.20e-02 0.199 0.106 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0999 0.104 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 4.10e-01 0.0881 0.107 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.23e-03 0.332 0.101 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 6.37e-01 0.0472 0.1 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 4.06e-01 0.0881 0.106 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0384 0.108 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 6.30e-01 0.0524 0.108 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 1.48e-01 -0.152 0.105 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 3.19e-01 0.101 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.23e-01 0.133 0.109 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0949 0.104 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00366 0.106 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 1.61e-01 -0.142 0.101 0.277 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 4.91e-01 0.0689 0.0999 0.277 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 1.08e-01 -0.154 0.0953 0.277 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0429 0.101 0.277 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 8.93e-03 0.263 0.0996 0.277 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0418 0.1 0.277 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0123 0.104 0.277 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 7.64e-01 0.0304 0.101 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0714 0.104 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0103 0.0899 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 9.71e-02 0.166 0.0998 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.23e-02 0.26 0.103 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.91e-01 0.114 0.108 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 1.69e-01 0.142 0.103 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 1.94e-02 -0.185 0.0784 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0312 0.101 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0665 0.0875 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 5.11e-01 0.0586 0.089 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.11e-01 0.161 0.101 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.94e-01 0.0837 0.0981 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0553 0.109 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 8.32e-02 0.194 0.111 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0233 0.116 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 1.06e-01 -0.143 0.0882 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 5.75e-01 -0.058 0.103 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.85e-01 0.144 0.108 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0581 0.113 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 2.85e-01 0.11 0.103 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 6.77e-02 -0.159 0.0864 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0687 0.0983 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0458 0.0911 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0332 0.0932 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.69e-04 0.347 0.0935 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.26e-01 0.0996 0.101 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 4.37e-01 -0.08 0.103 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 2.82e-01 0.139 0.128 0.252 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0666 0.135 0.252 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 1.35e-01 -0.216 0.144 0.252 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.64e-01 -0.038 0.126 0.252 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 5.16e-01 0.0822 0.126 0.252 PB L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 1.54e-01 -0.179 0.125 0.252 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 4.16e-01 0.113 0.138 0.252 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 8.77e-01 0.0147 0.0949 0.276 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 2.52e-02 -0.215 0.0954 0.276 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 2.03e-01 0.123 0.0965 0.276 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 2.54e-02 0.189 0.0838 0.276 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 3.42e-03 -0.247 0.0833 0.276 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0322 0.0584 0.276 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0419 0.0988 0.276 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0355 0.0997 0.274 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 9.89e-01 0.00148 0.107 0.274 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0438 0.0979 0.274 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 5.36e-01 -0.062 0.1 0.274 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 6.86e-03 0.281 0.103 0.274 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 5.41e-01 -0.062 0.101 0.274 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 5.80e-02 0.189 0.0993 0.274 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.49e-01 0.0936 0.0998 0.263 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00697 0.101 0.263 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0532 0.0995 0.263 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 6.31e-01 0.0415 0.0864 0.263 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.52e-01 0.125 0.109 0.263 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.63e-01 0.0888 0.0973 0.263 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 4.64e-02 0.175 0.0871 0.263 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 5.20e-01 0.0605 0.0938 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0633 0.0938 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00452 0.0991 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0173 0.0696 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.92e-04 0.362 0.0955 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.93e-01 0.0914 0.0868 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 2.10e-01 -0.13 0.103 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 1.21e-01 -0.163 0.104 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 6.52e-01 -0.044 0.0973 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 8.56e-01 0.0153 0.0843 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 1.21e-04 0.36 0.0919 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.53e-01 0.112 0.0976 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.04e-01 -0.113 0.109 0.285 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 4.43e-01 0.09 0.117 0.285 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 2.37e-01 -0.136 0.114 0.285 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0675 0.11 0.285 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 9.27e-01 0.0107 0.117 0.285 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 5.18e-01 0.0714 0.11 0.285 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 9.35e-01 0.00936 0.115 0.285 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0354 0.105 0.267 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0142 0.0978 0.267 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 7.65e-01 0.0299 0.0999 0.267 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0457 0.0953 0.267 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.70e-02 0.231 0.104 0.267 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 1.03e-01 0.174 0.106 0.267 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 3.38e-01 0.0924 0.0962 0.269 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 9.24e-03 -0.274 0.104 0.269 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 4.05e-01 0.0869 0.104 0.269 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 5.61e-01 0.0568 0.0973 0.269 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 4.71e-01 0.0736 0.102 0.269 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 3.42e-01 0.0989 0.104 0.269 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 2.72e-01 -0.129 0.117 0.274 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 3.47e-01 -0.108 0.114 0.274 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 3.08e-01 -0.119 0.117 0.274 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 8.04e-01 -0.026 0.105 0.274 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 5.32e-02 0.227 0.116 0.274 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0624 0.12 0.274 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 3.58e-01 0.0958 0.104 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 8.24e-01 0.0216 0.097 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 7.00e-01 0.0413 0.107 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 9.39e-01 0.00717 0.0931 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 6.87e-01 0.0303 0.0752 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.27e-04 0.359 0.0957 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0548 0.0959 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 4.65e-02 0.204 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 5.36e-02 0.195 0.101 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00343 0.104 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 8.05e-01 -0.024 0.0975 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.41e-01 0.0246 0.0744 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.13e-08 0.569 0.0977 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0719 0.0903 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 5.91e-01 0.0569 0.106 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0217 0.0957 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 6.97e-02 -0.168 0.092 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0241 0.0933 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 9.46e-01 0.00436 0.0645 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 2.11e-06 0.441 0.0905 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 6.61e-02 0.149 0.0809 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 6.25e-01 0.045 0.092 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 4.97e-02 -0.205 0.104 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 6.15e-01 0.0521 0.103 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 9.83e-01 0.00189 0.0882 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 3.44e-02 0.216 0.101 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 2.67e-02 0.212 0.0951 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253240 sc-eQTL 9.65e-02 -0.128 0.0769 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27404 sc-eQTL 5.69e-01 -0.053 0.0929 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651785 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0855 0.083 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 556039 sc-eQTL 7.60e-01 0.0254 0.0831 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 sc-eQTL 6.21e-04 0.333 0.0958 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903874 sc-eQTL 1.75e-01 0.121 0.089 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -183201 sc-eQTL 9.70e-01 0.00406 0.109 0.272 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -253240 eQTL 0.00181 -0.0638 0.0204 0.0 0.0 0.248
ENSG00000088035 ALG6 -27404 eQTL 3.53e-09 -0.089 0.0149 0.0 0.0 0.248
ENSG00000125703 ATG4C 556039 eQTL 0.0342 -0.0408 0.0192 0.0 0.0 0.248
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 eQTL 5.17e-17 0.277 0.0324 0.0 0.0 0.248

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -253240 1.28e-06 1.27e-06 2.92e-07 1.23e-06 3.81e-07 6.12e-07 1.46e-06 4.2e-07 1.7e-06 6.44e-07 2.07e-06 8.75e-07 2.6e-06 3.1e-07 4.89e-07 9.36e-07 9.41e-07 9.53e-07 7.22e-07 4.38e-07 7.58e-07 1.89e-06 1.05e-06 5.54e-07 2.41e-06 7.81e-07 1.06e-06 8.66e-07 1.62e-06 1.23e-06 8.51e-07 2.95e-07 2.88e-07 5.89e-07 5.52e-07 5.08e-07 7.34e-07 3.1e-07 5.11e-07 2.93e-07 3.04e-07 1.7e-06 1.93e-07 1.3e-07 3.07e-07 2.33e-07 2.56e-07 6.05e-08 1.85e-07
ENSG00000125703 ATG4C 556039 3.77e-07 2.5e-07 7.45e-08 2.61e-07 1.11e-07 1.25e-07 3.11e-07 7.65e-08 2.26e-07 1.37e-07 2.68e-07 1.86e-07 3.95e-07 8.26e-08 9.12e-08 1.14e-07 8.42e-08 2.66e-07 9.19e-08 7.49e-08 1.39e-07 2.24e-07 2e-07 5.11e-08 3.41e-07 1.9e-07 1.57e-07 1.61e-07 1.54e-07 1.89e-07 1.59e-07 5.3e-08 5.09e-08 9.61e-08 1.22e-07 5.14e-08 6.87e-08 5.8e-08 4.72e-08 8.2e-08 3.68e-08 2.41e-07 3.65e-08 2.07e-08 4.99e-08 8.42e-09 9.1e-08 0.0 4.52e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -253550 1.27e-06 1.27e-06 2.92e-07 1.23e-06 3.79e-07 6.09e-07 1.46e-06 4.2e-07 1.7e-06 6.44e-07 2.07e-06 8.75e-07 2.56e-06 3.1e-07 4.89e-07 9.36e-07 9.64e-07 9.58e-07 7.22e-07 4.38e-07 7.58e-07 1.91e-06 1.05e-06 5.54e-07 2.41e-06 7.81e-07 1.06e-06 8.66e-07 1.62e-06 1.16e-06 8.51e-07 3.07e-07 2.88e-07 5.89e-07 5.52e-07 5.08e-07 7.34e-07 3.1e-07 5.11e-07 2.93e-07 3.18e-07 1.61e-06 1.93e-07 1.3e-07 3.07e-07 2.33e-07 2.56e-07 6.05e-08 1.85e-07