logo

Genes within 1Mb (chr1:63203741:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0564 0.1 0.152 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.15e-01 0.0111 0.104 0.152 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0311 0.104 0.152 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000931 0.0723 0.152 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0196 0.115 0.152 B L1
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 6.59e-01 0.044 0.0998 0.152 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 3.44e-01 0.112 0.118 0.152 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0434 0.0846 0.152 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0585 0.0933 0.152 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.41e-01 0.00701 0.0946 0.152 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0962 0.0761 0.152 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 9.90e-01 0.00133 0.108 0.152 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00093 0.0741 0.152 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 3.83e-01 -0.085 0.0971 0.152 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 3.25e-01 0.0931 0.0943 0.152 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0602 0.104 0.152 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 8.68e-01 0.0176 0.106 0.152 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 1.40e-01 -0.148 0.0998 0.152 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 8.38e-01 -0.023 0.112 0.152 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 1.91e-01 0.114 0.087 0.152 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0644 0.112 0.152 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0924 0.104 0.155 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 1.31e-01 -0.162 0.107 0.155 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 2.68e-01 0.122 0.11 0.155 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 1.80e-01 -0.115 0.0858 0.155 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 1.18e-01 0.188 0.12 0.155 DC L1
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 7.02e-01 0.0403 0.105 0.155 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 1.90e-01 -0.137 0.104 0.155 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 8.11e-01 0.0243 0.101 0.152 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.73e-01 -0.017 0.106 0.152 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.40e-01 0.034 0.102 0.152 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.36e-01 0.0818 0.0689 0.152 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 6.72e-01 0.0463 0.109 0.152 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 6.20e-01 0.0445 0.0896 0.152 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 2.63e-02 0.196 0.0878 0.152 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0149 0.104 0.152 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.74e-01 0.00276 0.0858 0.152 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0496 0.092 0.152 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 1.61e-01 -0.16 0.114 0.152 NK L1
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 5.80e-01 0.0566 0.102 0.152 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 9.42e-01 0.00909 0.124 0.152 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 1.63e-01 -0.137 0.098 0.152 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00149 0.0989 0.152 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.98e-01 0.000249 0.101 0.152 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0441 0.0874 0.152 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 1.66e-01 -0.107 0.0772 0.152 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 3.65e-01 0.0609 0.0671 0.152 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 4.56e-01 0.0893 0.119 0.152 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0703 0.133 0.153 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 7.86e-01 0.0345 0.127 0.153 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0198 0.119 0.153 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 9.33e-01 0.0105 0.125 0.153 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 5.44e-01 0.074 0.122 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 2.96e-01 -0.138 0.132 0.153 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 2.95e-02 0.25 0.114 0.153 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0518 0.12 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 2.60e-01 0.137 0.121 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 3.81e-01 -0.102 0.116 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.12e-01 0.123 0.0979 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 6.53e-01 0.0526 0.117 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 8.81e-01 0.0176 0.117 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 9.82e-01 0.00259 0.116 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 5.03e-01 0.0793 0.118 0.153 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0164 0.12 0.153 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 2.50e-01 -0.13 0.112 0.153 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 3.04e-01 0.11 0.107 0.153 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 8.71e-02 0.209 0.122 0.153 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0241 0.124 0.153 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0184 0.122 0.153 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0822 0.119 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.04e-01 0.0145 0.12 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 6.62e-01 0.0503 0.115 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0716 0.0883 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0397 0.117 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0342 0.103 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 2.92e-01 0.132 0.125 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 8.06e-02 -0.205 0.117 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0451 0.123 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0352 0.118 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0831 0.113 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 9.45e-01 0.00856 0.123 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 1.72e-01 0.16 0.117 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 5.92e-01 0.0658 0.122 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0877 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.58e-02 0.224 0.129 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 3.49e-01 -0.107 0.114 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 1.18e-01 0.184 0.117 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 3.53e-01 0.117 0.126 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00997 0.12 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0894 0.12 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0959 0.0965 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0223 0.105 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.52e-01 0.0326 0.103 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 9.33e-01 0.00763 0.0913 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 7.19e-01 0.0402 0.112 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 6.18e-01 0.0425 0.0852 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 7.60e-01 0.0338 0.111 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 1.61e-01 0.138 0.0981 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.74e-01 0.0182 0.114 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.14e-01 0.011 0.101 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 6.62e-03 -0.266 0.097 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0461 0.116 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0334 0.0954 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0784 0.112 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 5.72e-01 0.066 0.117 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 3.02e-01 -0.121 0.117 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.50e-01 0.0365 0.114 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0482 0.111 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 6.20e-01 -0.057 0.115 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0494 0.109 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 3.00e-01 -0.123 0.119 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 8.13e-02 0.186 0.106 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.96e-01 0.000572 0.114 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.86e-01 0.0293 0.108 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 9.42e-01 0.00836 0.115 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0403 0.119 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 6.13e-01 0.0541 0.107 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 1.67e-01 -0.169 0.122 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0154 0.107 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 2.47e-02 -0.247 0.109 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 8.75e-01 -0.018 0.114 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.27e-01 -0.132 0.109 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 8.91e-01 0.0153 0.111 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 1.77e-01 0.127 0.0935 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 7.47e-01 0.0339 0.105 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0704 0.119 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.58e-01 0.0217 0.121 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0526 0.118 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 8.22e-02 -0.209 0.12 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 3.57e-01 0.108 0.117 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 3.00e-01 0.117 0.112 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 7.06e-01 -0.045 0.119 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 2.16e-01 0.152 0.122 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0349 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0283 0.12 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0431 0.115 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 7.00e-01 0.0481 0.124 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 9.78e-01 0.00324 0.119 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 4.32e-01 0.0949 0.121 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 9.21e-01 0.0116 0.116 0.152 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 3.37e-01 0.111 0.115 0.152 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0508 0.11 0.152 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0971 0.116 0.152 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 3.93e-02 -0.239 0.115 0.152 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 2.95e-01 -0.121 0.115 0.152 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0394 0.12 0.152 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0416 0.116 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.53e-01 0.00696 0.119 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0339 0.103 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0353 0.115 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 2.16e-01 -0.148 0.119 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 1.15e-01 -0.194 0.123 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0018 0.118 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 6.17e-02 0.171 0.0909 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 1.64e-01 0.161 0.116 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 3.99e-01 0.0854 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 7.02e-02 -0.186 0.102 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0778 0.117 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 2.72e-01 0.125 0.113 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0651 0.126 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 8.30e-01 0.0272 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 1.42e-01 -0.192 0.13 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 6.78e-01 0.0417 0.1 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 8.89e-01 0.0163 0.117 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 3.48e-01 -0.115 0.122 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0046 0.128 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00121 0.117 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 4.00e-01 0.084 0.0996 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.06e-01 0.0133 0.113 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0505 0.104 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.78e-01 0.116 0.107 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 2.45e-01 -0.129 0.11 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0982 0.116 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 6.52e-01 0.0533 0.118 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 3.69e-01 0.13 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0921 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.08e-01 0.0188 0.163 0.144 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 9.61e-01 0.00702 0.142 0.144 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 3.71e-01 -0.127 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 4.22e-02 -0.285 0.138 0.144 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 8.92e-01 0.0212 0.156 0.144 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 9.20e-01 0.0107 0.106 0.152 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 5.17e-01 -0.07 0.108 0.152 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 1.49e-01 0.156 0.108 0.152 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0527 0.0948 0.152 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0521 0.0951 0.152 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0166 0.0654 0.152 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0503 0.111 0.152 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 4.06e-01 0.0938 0.113 0.152 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0994 0.121 0.152 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 4.80e-01 0.0783 0.111 0.152 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 9.12e-01 0.0125 0.113 0.152 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 4.97e-01 0.0806 0.118 0.152 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 1.36e-01 0.17 0.114 0.152 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 3.08e-01 -0.116 0.113 0.152 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 2.57e-01 -0.128 0.113 0.151 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 1.87e-01 -0.151 0.114 0.151 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 3.70e-01 0.101 0.112 0.151 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.50e-01 -0.112 0.0973 0.151 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0261 0.124 0.151 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 8.76e-01 0.0172 0.11 0.151 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0312 0.0994 0.151 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 5.37e-01 0.0649 0.105 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 6.48e-01 0.048 0.105 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0816 0.111 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0105 0.0778 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0505 0.11 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 2.49e-01 0.112 0.0969 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 9.45e-01 0.00803 0.117 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0717 0.118 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.68e-01 0.00438 0.11 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 1.59e-01 0.134 0.0946 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 1.28e-01 0.163 0.107 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 5.29e-01 0.0695 0.11 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 7.93e-01 -0.034 0.129 0.148 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 4.29e-02 -0.278 0.136 0.148 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.05e-01 0.0513 0.135 0.148 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 7.28e-01 -0.045 0.129 0.148 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 3.67e-01 -0.124 0.137 0.148 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 3.03e-01 0.134 0.13 0.148 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 2.23e-03 0.407 0.131 0.148 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 7.51e-01 0.0371 0.117 0.153 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0332 0.109 0.153 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00974 0.111 0.153 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 5.88e-01 0.0576 0.106 0.153 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 5.99e-01 0.0616 0.117 0.153 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 5.98e-01 0.0628 0.119 0.153 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0386 0.106 0.156 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00264 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0782 0.115 0.156 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 1.34e-01 0.16 0.107 0.156 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 2.59e-01 0.127 0.112 0.156 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 1.59e-01 -0.161 0.114 0.156 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 3.71e-01 -0.111 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0777 0.12 0.164 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 9.29e-01 -0.011 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.63e-01 -0.123 0.11 0.164 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 1.89e-01 0.162 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 8.05e-01 0.0312 0.126 0.164 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 5.87e-02 -0.206 0.108 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0118 0.112 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 3.92e-01 0.106 0.123 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 3.11e-01 -0.108 0.107 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 7.40e-02 0.154 0.0859 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 1.33e-01 0.171 0.113 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0544 0.11 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 5.90e-01 0.064 0.118 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 1.36e-01 -0.174 0.116 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0289 0.121 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 7.74e-01 0.0324 0.113 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0752 0.0857 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0493 0.121 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 7.00e-01 0.0403 0.104 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 3.60e-01 0.112 0.122 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 8.01e-01 0.0272 0.108 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000568 0.105 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0519 0.105 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 3.79e-01 0.064 0.0726 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 8.50e-01 0.0204 0.108 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 2.72e-01 0.101 0.0917 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0352 0.102 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0774 0.116 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0257 0.115 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 2.79e-01 0.106 0.0977 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 4.70e-01 0.0822 0.114 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 2.53e-01 -0.122 0.107 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -389670 sc-eQTL 4.04e-02 0.185 0.0896 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -163834 sc-eQTL 7.84e-01 0.0298 0.109 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 515355 sc-eQTL 6.56e-01 0.0435 0.0973 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 419609 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0623 0.0971 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -389980 sc-eQTL 3.62e-01 -0.105 0.115 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 767444 sc-eQTL 4.51e-01 0.0788 0.104 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -319631 sc-eQTL 8.70e-01 0.0209 0.127 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -163834 eQTL 0.0302 0.0412 0.019 0.00125 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 \N -343341 1.31e-06 8.47e-07 2.06e-07 3.04e-07 1.4e-07 3.18e-07 7e-07 2.62e-07 8.36e-07 3.05e-07 1.09e-06 5.48e-07 1.23e-06 2.06e-07 3.72e-07 4.12e-07 6.44e-07 5.02e-07 3.5e-07 3.54e-07 2.82e-07 5.71e-07 5.41e-07 3.59e-07 1.42e-06 2.44e-07 5.04e-07 4.29e-07 6.84e-07 8.56e-07 4.32e-07 4.53e-08 1.21e-07 2.98e-07 3.42e-07 2.96e-07 2.36e-07 1.38e-07 1.13e-07 2.99e-08 2.37e-07 9.49e-07 6.44e-08 1.24e-08 1.73e-07 4.48e-08 1.41e-07 8.25e-08 5.32e-08
ENSG00000162607 \N 767444 2.8e-07 1.34e-07 5.49e-08 2.01e-07 9.8e-08 8.45e-08 1.6e-07 5.66e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.01e-07 1.69e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.5e-08 4.24e-08 1.44e-07 6.32e-08 4.8e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.87e-08 1.63e-07 1.22e-07 1.13e-07 9.92e-08 1.22e-07 1e-07 1.06e-07 3.59e-08 3.43e-08 8.89e-08 3.02e-08 2.69e-08 5.8e-08 9.17e-08 6.71e-08 3.67e-08 5.28e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.19e-08 3.2e-08 1.77e-08 1.21e-07 1.9e-09 4.99e-08
ENSG00000230798 \N -120700 4.35e-06 4.23e-06 7.8e-07 2e-06 1.12e-06 1.03e-06 2.95e-06 1.01e-06 3.53e-06 1.9e-06 4.34e-06 2.63e-06 6.61e-06 1.47e-06 1.14e-06 2.42e-06 1.79e-06 2.83e-06 1.38e-06 9.7e-07 2.35e-06 3.92e-06 3.54e-06 1.63e-06 4.81e-06 1.36e-06 2.1e-06 1.43e-06 4.26e-06 3.61e-06 1.96e-06 5.93e-07 7.51e-07 1.88e-06 2.09e-06 9.61e-07 9.13e-07 4.92e-07 1.07e-06 3.23e-07 5.21e-07 4.54e-06 4.47e-07 1.6e-07 4.38e-07 3.75e-07 7.28e-07 3.19e-07 3.23e-07