Genes within 1Mb (chr1:47602727:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 2.65e-01 -0.122 0.109 0.171 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0354 0.0676 0.171 B L1
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 3.50e-01 -0.105 0.113 0.171 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0579 0.104 0.171 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 9.31e-01 0.00569 0.0656 0.171 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 2.52e-01 0.0896 0.0779 0.171 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.94e-01 0.0366 0.0929 0.171 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0481 0.0647 0.171 CD4T L1
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0535 0.113 0.171 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0586 0.0768 0.171 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 2.02e-01 0.0748 0.0585 0.171 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 4.40e-01 0.0585 0.0757 0.171 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 1.71e-01 -0.139 0.101 0.171 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0322 0.0841 0.171 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.13e-01 0.0598 0.0912 0.171 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0314 0.0678 0.171 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 8.88e-01 0.00989 0.0704 0.171 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0227 0.102 0.173 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 4.30e-01 0.0861 0.109 0.173 DC L1
ENSG00000123473 STIL 288580 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0646 0.104 0.173 DC L1
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 7.61e-01 0.0355 0.116 0.173 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0617 0.103 0.173 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 3.70e-01 0.0915 0.102 0.173 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 411683 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0188 0.0985 0.173 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.20e-02 0.188 0.0963 0.173 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0474 0.0723 0.171 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 2.51e-01 -0.106 0.0917 0.171 Mono L1
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 5.34e-01 0.0522 0.0839 0.171 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 9.02e-02 0.184 0.108 0.171 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.05e-01 0.12 0.074 0.171 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.40e-02 0.16 0.0826 0.171 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0621 0.125 0.17 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 3.27e-02 -0.194 0.0903 0.17 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0519 0.0973 0.17 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 4.56e-01 0.0554 0.0741 0.17 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 9.55e-01 0.00399 0.0713 0.17 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0964 0.105 0.171 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 5.79e-02 -0.143 0.075 0.171 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 288580 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0986 0.0608 0.171 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 4.70e-01 0.0772 0.107 0.171 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0828 0.0744 0.171 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 7.04e-01 0.0368 0.0968 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 7.52e-01 0.0433 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0176 0.131 0.176 B_Activated L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 1.58e-01 -0.15 0.106 0.176 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.96e-01 0.0585 0.11 0.176 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000981 0.135 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 2.34e-01 0.152 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0318 0.125 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 1.46e-01 -0.149 0.102 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 2.50e-01 0.134 0.116 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 2.45e-01 0.137 0.118 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 5.09e-01 0.0671 0.101 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0632 0.098 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.69e-01 0.0206 0.125 0.172 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 5.15e-01 0.0742 0.114 0.172 B_Memory L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 6.31e-01 0.0516 0.107 0.172 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 4.95e-01 -0.078 0.114 0.172 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 4.15e-01 0.0876 0.107 0.172 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 6.01e-01 0.0551 0.105 0.172 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0641 0.118 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0977 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00999 0.119 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0401 0.118 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0705 0.0831 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 6.41e-01 0.0445 0.0954 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 7.07e-01 0.0457 0.121 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0509 0.108 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 2.76e-01 -0.133 0.122 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 3.04e-02 -0.239 0.11 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 5.65e-01 0.0536 0.0929 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 3.19e-02 0.216 0.1 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.12e-01 0.03 0.126 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0402 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 4.75e-01 0.0742 0.104 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 9.85e-02 -0.188 0.113 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 2.65e-01 0.127 0.113 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 2.27e-01 0.142 0.117 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0301 0.11 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0373 0.0719 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00865 0.118 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0711 0.084 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.37e-01 0.0939 0.063 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 7.07e-01 0.0272 0.0722 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.06e-02 0.227 0.121 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0686 0.0916 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 1.59e-01 -0.163 0.115 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 2.94e-01 -0.111 0.105 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 8.94e-01 0.0105 0.0785 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 7.63e-01 0.0243 0.0802 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 2.00e-01 0.149 0.116 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0525 0.0929 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 4.60e-01 0.0903 0.122 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 2.24e-01 -0.142 0.117 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.37e-02 0.22 0.0884 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 6.13e-01 0.051 0.101 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 7.35e-02 -0.215 0.119 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 6.86e-01 0.0381 0.094 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 9.34e-01 0.00909 0.11 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 8.71e-01 0.0152 0.0932 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00755 0.093 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0834 0.119 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0626 0.0875 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 6.56e-02 0.186 0.101 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0842 0.096 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0505 0.09 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 7.06e-01 0.0471 0.125 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0473 0.108 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00333 0.116 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 2.03e-02 0.252 0.108 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 4.43e-01 0.0787 0.102 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.29e-01 0.0275 0.127 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0709 0.116 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00547 0.116 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 8.81e-01 0.0173 0.115 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 3.38e-02 0.243 0.114 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00937 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 7.95e-03 -0.265 0.0989 0.171 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 288580 sc-eQTL 9.58e-01 0.00532 0.0997 0.171 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0766 0.108 0.171 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 9.71e-01 0.00351 0.098 0.171 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0653 0.0996 0.171 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 5.67e-01 -0.07 0.122 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 4.48e-02 0.222 0.11 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 2.11e-01 0.143 0.114 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.27e-01 0.172 0.112 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0609 0.113 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0869 0.131 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 5.45e-02 -0.197 0.102 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.87e-01 -0.058 0.107 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 7.00e-01 -0.033 0.0854 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0169 0.0873 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 3.75e-01 -0.11 0.123 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 8.33e-01 0.0257 0.122 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0522 0.112 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 6.68e-01 0.0438 0.102 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 2.95e-01 0.118 0.113 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0572 0.123 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 1.21e-01 -0.158 0.101 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0336 0.111 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.15e-01 0.152 0.0959 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 4.08e-01 0.0872 0.105 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 2.83e-01 -0.173 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 1.24e-01 0.165 0.107 0.156 PB L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 1.26e-01 -0.165 0.107 0.156 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 2.62e-01 -0.163 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.33e-01 -0.21 0.139 0.156 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 8.79e-01 0.0221 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 7.55e-01 0.039 0.125 0.172 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 4.18e-02 0.199 0.0971 0.172 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 288580 sc-eQTL 4.00e-02 -0.156 0.0754 0.172 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 9.61e-01 0.00546 0.113 0.172 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 8.83e-01 0.0149 0.101 0.172 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 4.98e-01 0.0757 0.112 0.172 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0258 0.118 0.171 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00773 0.0992 0.171 Treg L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 2.56e-01 -0.112 0.0985 0.171 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0879 0.108 0.171 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 5.69e-01 0.0559 0.0979 0.171 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 4.27e-02 0.181 0.089 0.171 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 3.36e-01 -0.104 0.108 0.171 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 3.87e-01 0.103 0.119 0.171 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 288580 sc-eQTL 4.50e-01 0.0782 0.103 0.171 cDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 7.85e-01 0.0334 0.122 0.171 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0894 0.106 0.171 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 3.36e-02 0.252 0.118 0.171 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 411683 sc-eQTL 8.96e-01 0.0131 0.1 0.171 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.112 0.171 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0223 0.0763 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 6.31e-01 -0.047 0.0978 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 8.00e-01 0.0256 0.101 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.30e-01 0.0746 0.119 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.79e-01 0.113 0.0837 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 3.76e-01 0.081 0.0914 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 9.48e-01 0.00599 0.092 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 1.98e-01 -0.138 0.107 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 8.74e-01 0.0173 0.109 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 3.68e-01 0.103 0.115 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 8.83e-02 0.154 0.0899 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.46e-02 0.201 0.104 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.09e-02 -0.285 0.151 0.164 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 9.49e-01 0.00848 0.133 0.164 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 288580 sc-eQTL 6.80e-01 0.0489 0.118 0.164 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 6.19e-01 0.07 0.14 0.164 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 1.06e-01 -0.208 0.128 0.164 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 3.59e-01 -0.126 0.137 0.164 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 3.85e-02 -0.211 0.101 0.171 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 1.31e-01 -0.183 0.121 0.171 intMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 1.46e-01 -0.169 0.116 0.171 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 9.35e-01 0.0098 0.12 0.171 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 6.19e-01 0.0498 0.1 0.171 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 1.36e-01 0.172 0.115 0.171 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.43e-01 0.0422 0.0908 0.174 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 4.22e-01 0.0899 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 4.65e-01 0.0681 0.0929 0.174 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 2.86e-02 0.256 0.116 0.174 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0995 0.111 0.174 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00133 0.108 0.174 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.52e-01 0.0249 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 2.50e-01 -0.158 0.137 0.167 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 288580 sc-eQTL 1.69e-01 -0.155 0.112 0.167 pDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0534 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 8.74e-01 0.0206 0.129 0.167 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 5.08e-01 -0.077 0.116 0.167 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 411683 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0542 0.104 0.167 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 4.82e-02 0.243 0.122 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 8.83e-01 0.0185 0.125 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0846 0.0927 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 4.49e-01 0.0891 0.117 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 5.36e-01 0.0719 0.116 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 8.02e-01 0.0232 0.0925 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 8.08e-01 0.0229 0.0941 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0533 0.116 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 1.92e-01 -0.128 0.0979 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0606 0.12 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 2.22e-01 -0.135 0.111 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0112 0.0769 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 1.76e-01 0.127 0.0935 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0317 0.0739 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0951 0.0937 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 5.24e-01 0.0619 0.0969 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 3.66e-01 0.0998 0.11 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 9.08e-02 0.131 0.0769 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.66e-02 0.16 0.0832 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0737 0.0767 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 5.65e-01 -0.061 0.106 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0482 0.0855 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 1.61e-01 0.164 0.117 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 9.95e-01 0.000598 0.0997 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 4.43e-01 0.0767 0.0997 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 985884 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0978 0.128 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 928860 sc-eQTL 1.03e-02 -0.237 0.0916 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 985836 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0756 0.101 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 883613 sc-eQTL 4.10e-01 0.0638 0.0773 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 268930 sc-eQTL 5.97e-01 0.0386 0.073 0.17 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079277 MKNK1 985884 eQTL 0.0888 0.0259 0.0152 0.00231 0.0 0.209
ENSG00000132122 SPATA6 -869481 eQTL 0.0634 0.0411 0.0221 0.00112 0.0 0.209
ENSG00000142961 MOB3C 985836 eQTL 0.0242 0.0517 0.0229 0.0 0.0 0.209
ENSG00000272491 AL109659.2 -626834 eQTL 0.00214 0.117 0.0381 0.00429 0.00121 0.209


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000159658 \N 883613 2.61e-07 1.1e-07 3.59e-08 1.78e-07 8.92e-08 9.3e-08 1.41e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.6e-07 8.03e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.89e-08 4.63e-08 1.1e-07 5.21e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.3e-07 4.26e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.58e-08 4.1e-08 3.09e-08 8.21e-08 8.93e-08 3.77e-08 4.84e-08 9.44e-08 7.92e-08 3.55e-08 4.18e-08 1.35e-07 4.14e-08 1.1e-08 4.7e-08 1.69e-08 1.25e-07 3.89e-09 4.79e-08
ENSG00000224805 \N 423477 4.21e-07 2.5e-07 6.57e-08 2.53e-07 1.08e-07 9.31e-08 2.63e-07 6.2e-08 1.86e-07 1.05e-07 2.18e-07 1.46e-07 3.18e-07 8.26e-08 6.93e-08 9.48e-08 6.63e-08 2.15e-07 1.13e-07 8.87e-08 1.24e-07 1.9e-07 1.81e-07 4.15e-08 2.99e-07 1.56e-07 1.39e-07 1.52e-07 1.44e-07 2.1e-07 1.43e-07 4.4e-08 5.09e-08 9.72e-08 1.16e-07 5.14e-08 6.39e-08 7.61e-08 5.78e-08 7.28e-08 5.81e-08 2.65e-07 3.19e-08 1.23e-08 1.19e-07 9.65e-09 8.98e-08 0.0 5.71e-08