logo

Genes within 1Mb (chr1:47326691:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 1.89e-02 0.237 0.1 0.203 B L1
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.31e-01 0.137 0.0901 0.203 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00297 0.0627 0.203 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 2.87e-01 -0.103 0.0964 0.203 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 4.51e-02 0.121 0.0602 0.203 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 3.58e-04 -0.255 0.0703 0.203 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00855 0.0842 0.203 CD4T L1
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 2.42e-01 0.0731 0.0623 0.203 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 6.22e-01 -0.029 0.0587 0.203 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0116 0.0697 0.203 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 6.19e-02 -0.099 0.0527 0.203 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 2.08e-06 -0.318 0.0651 0.203 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 5.18e-01 0.0602 0.093 0.203 CD8T L1
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 3.63e-01 0.0795 0.0872 0.203 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 8.58e-01 0.0138 0.0769 0.203 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 1.71e-02 0.198 0.0823 0.203 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0889 0.0617 0.203 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.61e-04 -0.239 0.0622 0.203 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0224 0.0933 0.203 DC L1
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 2.52e-01 0.0893 0.0778 0.203 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0256 0.0991 0.203 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.49e-01 0.00644 0.1 0.203 DC L1
ENSG00000123473 STIL 12544 sc-eQTL 4.46e-01 0.0726 0.095 0.203 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0425 0.0946 0.203 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 8.93e-01 0.0126 0.0935 0.203 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 135647 sc-eQTL 9.95e-02 0.148 0.0897 0.203 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.03e-01 -0.145 0.0885 0.203 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 8.68e-01 0.0112 0.0672 0.203 Mono L1
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 2.30e-01 -0.101 0.0839 0.203 Mono L1
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 5.65e-01 0.0575 0.0999 0.203 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 1.83e-01 0.113 0.085 0.203 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.203 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0565 0.069 0.203 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 7.33e-01 0.0264 0.0773 0.203 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 5.13e-01 0.0723 0.11 0.202 NK L1
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.16e-01 0.134 0.085 0.202 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00471 0.081 0.202 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 5.18e-02 -0.167 0.0856 0.202 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 9.99e-01 0.000112 0.0658 0.202 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 4.24e-04 -0.22 0.0614 0.202 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.25e-01 0.0469 0.0957 0.203 Other_T L1
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 3.14e-01 -0.103 0.102 0.203 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.81e-01 0.0604 0.0687 0.203 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 12544 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0314 0.0556 0.203 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 3.70e-02 -0.202 0.0961 0.203 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0627 0.0678 0.203 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 3.88e-02 -0.181 0.0872 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.63e-01 0.0378 0.125 0.191 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 3.69e-01 -0.106 0.118 0.191 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.04e-01 -0.123 0.119 0.191 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 4.67e-01 0.0735 0.101 0.191 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 5.45e-01 0.0747 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.66e-01 -0.161 0.116 0.191 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.21e-02 0.201 0.111 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.54e-01 0.146 0.102 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00647 0.0914 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0035 0.105 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0026 0.0905 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 3.85e-04 -0.307 0.085 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 2.59e-01 0.128 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.70e-01 0.149 0.108 0.205 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0413 0.103 0.205 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 3.98e-01 0.0873 0.103 0.205 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 2.95e-01 0.102 0.0969 0.205 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 4.89e-03 -0.266 0.0934 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 3.18e-01 0.106 0.106 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 8.49e-01 0.0176 0.0924 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 2.97e-01 0.0922 0.0882 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00144 0.107 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 4.69e-01 0.0544 0.075 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 6.43e-03 -0.233 0.0847 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.32e-02 0.202 0.108 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 9.83e-01 0.00218 0.0998 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0608 0.0971 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 4.48e-02 -0.199 0.0984 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 5.01e-01 0.0562 0.0833 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.02e-01 -0.148 0.0903 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00899 0.114 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 5.54e-03 -0.29 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 1.35e-01 0.157 0.104 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0266 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0165 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.27e-01 -0.162 0.105 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0652 0.0999 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 3.80e-01 0.0662 0.0753 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 7.03e-01 0.025 0.0654 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 6.45e-01 0.0353 0.0765 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0597 0.0574 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.00e-05 -0.284 0.0627 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 5.44e-01 0.0664 0.109 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 3.49e-01 0.0738 0.0786 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0749 0.0822 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00151 0.0946 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 4.37e-02 -0.142 0.0698 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 4.05e-06 -0.324 0.0685 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.27e-01 0.0514 0.106 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 6.04e-01 -0.048 0.0925 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.66e-01 0.0762 0.0841 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 2.07e-01 -0.134 0.106 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 7.84e-01 0.0224 0.0813 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 9.60e-04 -0.298 0.089 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0287 0.107 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.102 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00769 0.0834 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 2.63e-02 0.215 0.096 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 6.53e-01 0.0372 0.0826 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.18e-02 -0.206 0.0813 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0542 0.11 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0132 0.0977 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.62e-01 0.00384 0.0806 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0221 0.0933 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 5.57e-03 -0.243 0.0869 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.28e-02 -0.205 0.0816 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 8.78e-01 0.0174 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 3.94e-03 0.319 0.109 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0107 0.0981 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 4.17e-01 0.0857 0.105 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0533 0.0994 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.03e-01 -0.152 0.0926 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 3.30e-01 0.109 0.111 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 7.55e-02 -0.193 0.108 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 2.33e-01 0.122 0.102 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 5.14e-02 0.199 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 4.00e-01 0.0856 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 4.05e-02 -0.207 0.1 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 5.95e-01 0.049 0.092 0.203 MAIT L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0139 0.105 0.203 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 1.69e-01 -0.124 0.0896 0.203 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 12544 sc-eQTL 1.54e-01 0.127 0.0888 0.203 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0864 0.0962 0.203 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 1.02e-01 -0.143 0.0872 0.203 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0832 0.0891 0.203 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.08e-01 0.0417 0.111 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 7.21e-01 0.0361 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0857 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 2.43e-02 0.23 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 5.37e-01 0.0637 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0406 0.116 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0329 0.105 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 7.97e-01 0.0235 0.0912 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 1.55e-01 -0.135 0.0943 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 4.92e-01 0.0522 0.0759 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 3.89e-03 -0.222 0.076 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0293 0.109 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 2.24e-02 0.245 0.106 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0334 0.107 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 1.06e-01 -0.159 0.0979 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0241 0.0894 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 2.60e-01 -0.112 0.0987 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.00e-02 0.206 0.109 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 2.07e-01 0.125 0.0986 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 2.44e-01 -0.106 0.0905 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 1.72e-01 -0.134 0.098 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 7.95e-02 -0.15 0.0852 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 8.26e-03 -0.246 0.0921 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 3.58e-01 -0.12 0.13 0.211 PB L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 9.44e-01 0.00989 0.141 0.211 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 2.89e-01 0.0928 0.0872 0.211 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 2.11e-01 -0.147 0.117 0.211 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0479 0.114 0.211 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.33e-01 -0.176 0.116 0.211 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 2.98e-01 0.12 0.115 0.2 Pro_T L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0617 0.113 0.2 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 2.53e-03 0.271 0.0888 0.2 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 12544 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0245 0.0704 0.2 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0516 0.104 0.2 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 5.07e-01 0.0619 0.093 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.79e-01 -0.139 0.103 0.2 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0467 0.107 0.203 Treg L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00926 0.0969 0.203 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0876 0.0897 0.203 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0484 0.0979 0.203 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.0888 0.203 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.64e-02 -0.194 0.0803 0.203 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 9.72e-01 0.00354 0.1 0.198 cDC L2
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 5.42e-01 0.0663 0.108 0.198 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.23e-01 -0.174 0.112 0.198 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 8.89e-01 0.0154 0.11 0.198 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 12544 sc-eQTL 3.64e-01 0.0867 0.0953 0.198 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 5.02e-01 0.0656 0.0976 0.198 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 3.85e-01 0.0958 0.11 0.198 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 135647 sc-eQTL 1.82e-01 0.123 0.0918 0.198 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.36e-01 -0.155 0.103 0.198 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.60e-01 0.0315 0.0714 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 8.90e-01 0.0117 0.0849 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 9.00e-01 0.0136 0.108 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.21e-01 0.091 0.0914 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 5.81e-01 0.0614 0.111 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000189 0.0788 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.78e-01 0.116 0.0854 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 2.40e-01 -0.101 0.0859 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 1.95e-02 -0.22 0.0933 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 5.21e-01 0.0682 0.106 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 4.95e-01 0.0688 0.101 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 2.49e-01 0.124 0.107 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0456 0.0846 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0489 0.098 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.86e-01 0.0378 0.139 0.209 gdT L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 6.79e-01 -0.057 0.137 0.209 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 6.28e-01 0.0588 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 12544 sc-eQTL 3.03e-01 0.11 0.107 0.209 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 3.63e-01 -0.116 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00397 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 2.54e-01 -0.142 0.124 0.209 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 6.50e-01 0.0426 0.0939 0.202 intMono L2
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0124 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.57e-01 0.154 0.109 0.202 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.04e-01 0.115 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0107 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0399 0.0917 0.202 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0872 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.38e-01 0.0281 0.084 0.204 ncMono L2
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0789 0.107 0.204 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0526 0.109 0.204 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 4.02e-01 0.0868 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 7.05e-01 0.0412 0.108 0.204 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0877 0.102 0.204 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 5.96e-01 0.0532 0.1 0.204 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 7.52e-01 0.0371 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 1.05e-01 0.151 0.0925 0.218 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 2.39e-01 0.132 0.112 0.218 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 9.22e-01 0.0118 0.121 0.218 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 12544 sc-eQTL 2.95e-01 0.104 0.0987 0.218 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 2.24e-01 -0.138 0.113 0.218 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 7.53e-01 0.0322 0.102 0.218 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 135647 sc-eQTL 3.45e-01 0.0861 0.0909 0.218 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.38e-01 -0.161 0.108 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 1.52e-01 0.161 0.112 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 1.23e-01 0.157 0.102 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0434 0.0838 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 6.09e-01 0.0538 0.105 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 3.51e-01 0.0778 0.0833 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 5.50e-04 -0.29 0.0825 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 1.02e-01 0.171 0.104 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 6.37e-01 0.0423 0.0896 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 2.98e-01 0.0925 0.0886 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 1.94e-01 -0.13 0.0999 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 2.19e-01 0.0854 0.0692 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 1.09e-02 -0.215 0.0836 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 9.63e-01 0.00324 0.069 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 1.67e-01 -0.112 0.0811 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 5.81e-01 0.0562 0.102 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 1.82e-01 0.117 0.0873 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 1.52e-01 0.147 0.102 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0259 0.0723 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 6.97e-01 0.0306 0.0784 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 8.55e-01 0.0129 0.0703 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 932374 sc-eQTL 9.13e-01 0.0112 0.102 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 6.85e-01 0.0424 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 3.31e-01 0.0944 0.0968 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 7.15e-01 0.0392 0.107 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0774 0.091 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0573 0.0912 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 709848 sc-eQTL 5.71e-01 0.0644 0.114 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 986514 sc-eQTL 2.73e-01 0.0998 0.0908 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 652824 sc-eQTL 4.76e-01 -0.059 0.0825 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 709800 sc-eQTL 6.57e-02 -0.164 0.0887 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0419 0.0687 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -7106 sc-eQTL 7.92e-05 -0.252 0.0625 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000123473 STIL 12544 eQTL 9.49e-04 -0.0727 0.0219 0.00462 0.0043 0.219
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 eQTL 0.017 -0.0534 0.0223 0.0 0.0 0.219
ENSG00000162366 PDZK1IP1 135647 eQTL 4.59e-06 0.151 0.0327 0.0 0.0 0.219
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 -107950 eQTL 0.0162 -0.0692 0.0287 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079277 \N 709848 2.95e-07 1.5e-07 5.64e-08 2.15e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.62e-08 1.5e-07 8.53e-08 1.63e-07 1.23e-07 2.05e-07 8.13e-08 5.82e-08 7.98e-08 4.24e-08 1.56e-07 7.12e-08 5.04e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.98e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.26e-07 1e-07 1.14e-07 3.54e-08 3.51e-08 9.52e-08 3.02e-08 2.69e-08 5.51e-08 8.71e-08 6.58e-08 5.35e-08 5.48e-08 1.55e-07 5.2e-08 7.66e-09 2.82e-08 1.77e-08 1.15e-07 1.89e-09 4.83e-08
ENSG00000123473 STIL 12544 2.43e-05 2.65e-05 4.6e-06 1.33e-05 4.07e-06 1.09e-05 3.35e-05 3.73e-06 2.19e-05 1.13e-05 2.99e-05 1.29e-05 3.88e-05 1.12e-05 5.97e-06 1.33e-05 1.35e-05 2.01e-05 6.31e-06 5.66e-06 1.13e-05 2.5e-05 2.49e-05 7.45e-06 3.46e-05 6.14e-06 9.71e-06 9.19e-06 2.39e-05 2.23e-05 1.47e-05 1.65e-06 2.29e-06 5.98e-06 9.49e-06 4.56e-06 2.62e-06 2.99e-06 3.98e-06 2.88e-06 1.67e-06 3.15e-05 2.99e-06 2.71e-07 2.11e-06 2.98e-06 3.62e-06 1.52e-06 1.32e-06
ENSG00000142961 \N 709800 2.95e-07 1.5e-07 5.64e-08 2.15e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.62e-08 1.5e-07 8.53e-08 1.63e-07 1.23e-07 2.05e-07 8.13e-08 5.82e-08 7.98e-08 4.24e-08 1.56e-07 7.12e-08 5.04e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.98e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.26e-07 1e-07 1.14e-07 3.54e-08 3.51e-08 9.52e-08 3.02e-08 2.69e-08 5.51e-08 8.71e-08 6.58e-08 5.35e-08 5.48e-08 1.55e-07 5.2e-08 7.66e-09 2.82e-08 1.77e-08 1.15e-07 1.89e-09 4.83e-08
ENSG00000159658 EFCAB14 607577 3.53e-07 1.83e-07 6.55e-08 2.36e-07 1.05e-07 8.75e-08 2.63e-07 5.84e-08 1.85e-07 1.11e-07 2.07e-07 1.62e-07 2.94e-07 8.55e-08 6.12e-08 1.01e-07 4.25e-08 2.15e-07 7.42e-08 6.03e-08 1.23e-07 1.89e-07 1.69e-07 4.37e-08 2.59e-07 1.43e-07 1.29e-07 1.42e-07 1.39e-07 1.29e-07 1.43e-07 4.4e-08 3.74e-08 1.02e-07 5.5e-08 3.11e-08 5.1e-08 8.51e-08 6.21e-08 7.78e-08 4.53e-08 2.15e-07 5.27e-08 1.43e-08 3.61e-08 8.31e-09 7.83e-08 2.05e-09 4.97e-08
ENSG00000162366 PDZK1IP1 135647 4e-06 3.82e-06 5.1e-07 1.86e-06 7.59e-07 7.64e-07 2.39e-06 8.52e-07 2.61e-06 1.57e-06 3.95e-06 2.58e-06 5.6e-06 1.37e-06 8.94e-07 2.01e-06 1.55e-06 2.1e-06 1.46e-06 1.21e-06 1.54e-06 3.4e-06 3.44e-06 1.8e-06 4.69e-06 1.22e-06 1.57e-06 1.74e-06 3.17e-06 2.88e-06 2.05e-06 3.8e-07 6.65e-07 1.49e-06 1.82e-06 9.62e-07 8.91e-07 4.21e-07 1.27e-06 3.46e-07 2.39e-07 4.74e-06 5.41e-07 1.99e-07 3.41e-07 3.72e-07 8.5e-07 1.82e-07 1.53e-07
ENSG00000162368 \N -7106 3.32e-05 3.08e-05 5.99e-06 1.53e-05 5.54e-06 1.37e-05 4.22e-05 4.35e-06 2.79e-05 1.39e-05 3.59e-05 1.63e-05 4.6e-05 1.35e-05 6.69e-06 1.67e-05 1.65e-05 2.39e-05 7.5e-06 6.89e-06 1.42e-05 3.03e-05 3.03e-05 8.82e-06 4.09e-05 7.48e-06 1.27e-05 1.16e-05 3.04e-05 2.73e-05 1.83e-05 1.62e-06 2.59e-06 7.07e-06 1.14e-05 5.61e-06 3.1e-06 3.18e-06 4.65e-06 3.35e-06 1.76e-06 3.71e-05 3.63e-06 3.33e-07 2.43e-06 3.67e-06 4.08e-06 1.48e-06 1.59e-06
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 -107950 4.59e-06 4.86e-06 7.66e-07 2.59e-06 1.2e-06 1.39e-06 4.25e-06 9.91e-07 4.76e-06 2.44e-06 5.26e-06 3.6e-06 7.03e-06 2.4e-06 1.37e-06 3.05e-06 2.05e-06 3.18e-06 1.38e-06 1.02e-06 2.63e-06 4.53e-06 3.78e-06 1.4e-06 6.16e-06 1.37e-06 2.61e-06 1.82e-06 4.26e-06 4.23e-06 2.71e-06 6.26e-07 6.52e-07 1.87e-06 2.04e-06 9.43e-07 9.59e-07 4.92e-07 1.04e-06 3.61e-07 4.42e-07 5.71e-06 3.64e-07 1.95e-07 3.74e-07 4.11e-07 7.92e-07 2.26e-07 2.56e-07