Genes within 1Mb (chr1:45418208:TA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 1.37e-03 0.635 0.196 0.052 DC L1
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 7.24e-01 0.062 0.175 0.052 DC L1
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 4.93e-01 0.102 0.149 0.052 DC L1
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00121 0.176 0.052 DC L1
ENSG00000117425 PTCH2 574955 sc-eQTL 2.29e-01 0.216 0.179 0.052 DC L1
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 3.37e-02 -0.36 0.168 0.052 DC L1
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 9.55e-02 0.232 0.139 0.052 DC L1
ENSG00000117480 FAAH -976109 sc-eQTL 3.78e-01 -0.129 0.146 0.052 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 6.12e-01 0.0947 0.186 0.052 DC L1
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0678 0.172 0.052 DC L1
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 2.21e-01 0.2 0.163 0.052 DC L1
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 2.34e-01 -0.233 0.195 0.052 DC L1
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0819 0.179 0.052 DC L1
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 3.26e-01 0.194 0.197 0.052 DC L1
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 8.06e-01 0.0386 0.157 0.052 DC L1
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 3.43e-01 0.181 0.191 0.052 DC L1
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 8.77e-02 0.174 0.101 0.052 DC L1
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 4.79e-01 0.135 0.19 0.052 DC L1
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 7.73e-03 -0.496 0.184 0.052 DC L1
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 1.33e-01 -0.15 0.0994 0.052 DC L1
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 9.66e-01 0.00573 0.135 0.052 DC L1
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 4.24e-01 -0.146 0.182 0.052 DC L1
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 2.34e-01 0.204 0.171 0.052 DC L1
ENSG00000222009 BTBD19 609726 sc-eQTL 5.38e-01 -0.124 0.202 0.052 DC L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 4.59e-01 0.168 0.226 0.051 B_Activated L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 3.59e-01 -0.203 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 1.98e-01 0.284 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 1.82e-03 0.605 0.191 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117425 PTCH2 574955 sc-eQTL 3.50e-01 -0.125 0.133 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0167 0.223 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 1.51e-01 -0.25 0.173 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 6.44e-01 0.103 0.224 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 6.04e-01 -0.12 0.231 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 5.14e-01 -0.127 0.195 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 4.25e-01 0.179 0.224 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 2.14e-01 0.27 0.216 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0123 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0228 0.217 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 3.81e-01 -0.202 0.229 0.051 B_Activated L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 4.08e-01 0.0953 0.115 0.051 B_Activated L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 3.05e-01 -0.239 0.232 0.051 B_Activated L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 1.66e-01 -0.294 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 4.08e-01 0.16 0.192 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 9.28e-02 0.351 0.208 0.051 B_Activated L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 3.21e-01 -0.21 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0791 0.21 0.051 B_Activated L2
ENSG00000280670 CCDC163 -81871 sc-eQTL 4.85e-01 0.108 0.154 0.051 B_Activated L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 7.16e-01 0.072 0.197 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 3.26e-01 0.214 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 7.09e-01 0.0763 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0361 0.193 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 5.80e-01 0.124 0.224 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 2.89e-01 0.174 0.163 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0662 0.202 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 2.16e-01 0.268 0.216 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 4.44e-01 0.16 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 5.47e-01 0.127 0.211 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 3.86e-01 -0.18 0.207 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0413 0.196 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 8.01e-01 0.0536 0.213 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0707 0.0886 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 5.23e-01 -0.132 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0207 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 111999 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0191 0.188 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 4.75e-01 -0.134 0.187 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 3.04e-01 0.161 0.156 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00918 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 7.82e-01 0.0445 0.161 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0463 0.213 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 8.99e-01 0.0278 0.218 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0911 0.208 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 1.47e-01 -0.295 0.203 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 5.54e-03 -0.566 0.202 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 5.09e-01 -0.102 0.155 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -714828 sc-eQTL 3.51e-01 0.165 0.176 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 3.52e-01 -0.2 0.215 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 2.48e-01 -0.244 0.211 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 5.36e-01 0.138 0.223 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 1.69e-01 -0.29 0.21 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 7.19e-02 -0.356 0.197 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 2.71e-01 0.189 0.171 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 8.75e-01 0.0359 0.227 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00313 0.112 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 1.68e-01 -0.282 0.204 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0228 0.217 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 111999 sc-eQTL 7.00e-01 0.0759 0.196 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 4.40e-01 0.148 0.191 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 3.84e-01 0.129 0.148 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 8.75e-01 0.0334 0.213 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 5.49e-01 -0.107 0.178 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0614 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 2.28e-02 -0.455 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 1.77e-02 0.489 0.204 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 7.61e-01 0.0618 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 3.29e-02 -0.432 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 2.20e-01 0.221 0.179 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -714828 sc-eQTL 9.67e-01 0.00784 0.189 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 3.59e-04 0.727 0.2 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 2.69e-01 0.22 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 3.31e-01 -0.2 0.205 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 5.29e-01 0.125 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0385 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 5.64e-01 0.0868 0.15 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 2.59e-01 0.235 0.208 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 1.92e-01 -0.155 0.119 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 3.46e-01 -0.203 0.215 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 9.51e-01 0.0111 0.179 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 111999 sc-eQTL 1.58e-01 -0.291 0.205 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 5.41e-02 -0.348 0.18 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 3.54e-01 0.13 0.14 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 5.30e-01 -0.132 0.21 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 2.08e-01 -0.238 0.188 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 3.91e-01 0.169 0.197 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 3.66e-02 0.438 0.208 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 4.17e-01 0.168 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0288 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0671 0.192 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 5.40e-01 -0.112 0.183 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -714828 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0139 0.191 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 2.91e-01 -0.201 0.19 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 3.01e-01 -0.187 0.18 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 5.02e-01 -0.135 0.201 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 8.42e-01 0.0409 0.205 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 1.45e-01 0.289 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 7.55e-01 0.0591 0.189 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 1.02e-01 -0.294 0.179 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 4.06e-01 -0.185 0.222 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 2.13e-01 -0.122 0.0979 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 3.51e-01 -0.194 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0427 0.196 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 111999 sc-eQTL 7.66e-01 0.0535 0.18 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 5.25e-01 0.107 0.168 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 5.71e-01 -0.105 0.185 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 1.56e-02 -0.501 0.206 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 2.12e-01 -0.256 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 4.90e-01 0.146 0.211 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 7.07e-01 0.071 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 1.82e-01 0.281 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 6.64e-01 0.0924 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 6.05e-02 -0.34 0.18 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -714828 sc-eQTL 2.65e-01 0.224 0.201 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0619 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 7.95e-01 0.0554 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 4.39e-01 0.157 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 2.04e-01 0.286 0.225 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 3.16e-01 0.21 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00373 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0271 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 2.17e-01 -0.269 0.217 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 5.64e-02 -0.176 0.0915 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 9.47e-01 0.0125 0.19 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 4.70e-01 -0.149 0.206 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 111999 sc-eQTL 5.31e-01 0.118 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 4.36e-01 -0.146 0.187 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 8.55e-01 0.035 0.191 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 5.50e-01 -0.124 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 7.84e-03 0.514 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 1.48e-01 0.271 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 1.99e-01 0.253 0.196 0.056 cDC L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 7.38e-01 0.0587 0.175 0.056 cDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 574955 sc-eQTL 3.67e-01 0.152 0.168 0.056 cDC L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 2.67e-01 -0.208 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 8.57e-02 0.238 0.138 0.056 cDC L2
ENSG00000117480 FAAH -976109 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0332 0.194 0.056 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 1.56e-01 -0.286 0.2 0.056 cDC L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 8.95e-01 0.0253 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 7.04e-01 0.0699 0.184 0.056 cDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 1.30e-01 -0.327 0.215 0.056 cDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 5.09e-01 -0.13 0.197 0.056 cDC L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 7.98e-01 0.0545 0.213 0.056 cDC L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 9.85e-02 0.318 0.192 0.056 cDC L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 8.01e-01 0.0501 0.198 0.056 cDC L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 3.18e-01 0.0914 0.0913 0.056 cDC L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0441 0.199 0.056 cDC L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 1.11e-01 -0.319 0.199 0.056 cDC L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0613 0.124 0.056 cDC L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 2.50e-01 0.154 0.133 0.056 cDC L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 4.48e-02 -0.334 0.165 0.056 cDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 9.26e-01 0.0194 0.208 0.056 cDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 609726 sc-eQTL 6.94e-01 0.0732 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 2.72e-01 -0.219 0.199 0.051 intMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 7.43e-01 0.0695 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 3.26e-01 0.191 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 5.33e-02 -0.358 0.184 0.051 intMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 574955 sc-eQTL 4.15e-01 -0.14 0.172 0.051 intMono L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 9.20e-01 0.0195 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 4.91e-01 0.0806 0.117 0.051 intMono L2
ENSG00000117480 FAAH -976109 sc-eQTL 1.93e-01 0.255 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 4.21e-02 0.411 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 5.95e-01 -0.11 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 1.91e-01 -0.254 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 5.09e-01 0.134 0.203 0.051 intMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 3.31e-01 0.208 0.213 0.051 intMono L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 8.92e-01 -0.028 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 2.74e-01 -0.21 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 5.27e-01 0.117 0.185 0.051 intMono L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 2.43e-01 0.101 0.0866 0.051 intMono L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 7.63e-02 -0.371 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 1.35e-01 -0.294 0.196 0.051 intMono L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 3.04e-01 0.15 0.146 0.051 intMono L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 2.18e-02 -0.329 0.142 0.051 intMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 8.38e-01 0.0432 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 609726 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0788 0.193 0.051 intMono L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0327 0.188 0.052 ncMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 8.30e-01 0.0389 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 4.26e-01 -0.149 0.187 0.052 ncMono L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 5.26e-01 -0.114 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 574955 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00977 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0278 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 2.86e-01 0.168 0.157 0.052 ncMono L2
ENSG00000117480 FAAH -976109 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0697 0.202 0.052 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0662 0.206 0.052 ncMono L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 8.36e-01 -0.041 0.197 0.052 ncMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 3.19e-01 -0.203 0.203 0.052 ncMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 7.40e-01 0.0678 0.204 0.052 ncMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 7.69e-01 0.0626 0.213 0.052 ncMono L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 1.33e-01 -0.27 0.179 0.052 ncMono L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00475 0.173 0.052 ncMono L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 8.78e-01 0.0282 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 1.88e-01 0.105 0.0792 0.052 ncMono L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 5.67e-01 -0.104 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 4.01e-02 -0.396 0.191 0.052 ncMono L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00194 0.128 0.052 ncMono L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00657 0.126 0.052 ncMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0273 0.149 0.052 ncMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 609726 sc-eQTL 3.74e-03 -0.527 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000070759 TESK2 -72955 sc-eQTL 1.37e-01 0.33 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 431486 sc-eQTL 4.62e-01 0.168 0.229 0.051 pDC L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -802097 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0502 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000086015 MAST2 -368779 sc-eQTL 1.26e-01 -0.276 0.18 0.051 pDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 574955 sc-eQTL 3.58e-01 -0.164 0.178 0.051 pDC L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 sc-eQTL 1.24e-01 -0.298 0.193 0.051 pDC L2
ENSG00000117450 PRDX1 -104839 sc-eQTL 1.92e-01 0.227 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000117480 FAAH -976109 sc-eQTL 3.32e-01 -0.172 0.176 0.051 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 sc-eQTL 8.39e-01 0.0435 0.213 0.051 pDC L2
ENSG00000126088 UROD 407258 sc-eQTL 3.28e-01 -0.211 0.215 0.051 pDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 743727 sc-eQTL 1.67e-01 0.261 0.188 0.051 pDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 406884 sc-eQTL 2.63e-01 -0.252 0.224 0.051 pDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 -885400 sc-eQTL 5.87e-01 -0.123 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000132773 TOE1 78156 sc-eQTL 8.17e-01 0.0528 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000132780 NASP -165638 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0263 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000132781 MUTYH 77315 sc-eQTL 6.37e-01 0.0938 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000142937 RPS8 642957 sc-eQTL 3.18e-01 0.128 0.128 0.051 pDC L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 sc-eQTL 1.08e-01 0.35 0.217 0.051 pDC L2
ENSG00000159596 TMEM69 -269973 sc-eQTL 1.25e-02 -0.51 0.202 0.051 pDC L2
ENSG00000173660 UQCRH -885490 sc-eQTL 7.67e-02 -0.308 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000173846 PLK3 617831 sc-eQTL 8.31e-01 0.037 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000197429 IPP -332445 sc-eQTL 2.76e-01 -0.225 0.205 0.051 pDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 743516 sc-eQTL 3.00e-01 0.208 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 609726 sc-eQTL 5.70e-01 -0.125 0.22 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070759 TESK2 -72955 eQTL 0.00185 0.107 0.0343 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000086015 MAST2 -368779 eQTL 3.08e-12 0.313 0.0443 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 eQTL 0.00487 -0.0732 0.0259 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000117480 FAAH -976109 eQTL 0.0106 0.125 0.0488 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 eQTL 1.52e-05 0.242 0.0556 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000126088 UROD 407258 pQTL 0.0155 0.0813 0.0335 0.0 0.0 0.0488
ENSG00000132773 TOE1 78156 eQTL 0.000832 -0.102 0.0304 0.00443 0.00355 0.0496
ENSG00000132780 NASP -165638 eQTL 3.57e-08 -0.204 0.0366 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000132781 MUTYH 77738 eQTL 0.0227 0.0692 0.0303 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000159588 CCDC17 -205849 eQTL 1.5600000000000002e-21 -0.305 0.0312 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 eQTL 0.0171 0.0588 0.0246 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000162415 ZSWIM5 111999 eQTL 0.0345 -0.102 0.0483 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000197429 IPP -332442 eQTL 0.00229 -0.143 0.0467 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000222009 BTBD19 609726 eQTL 0.033 -0.0724 0.0339 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000281912 LINC01144 114298 eQTL 0.00156 0.245 0.0773 0.0 0.0 0.0496


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000070759 TESK2 -72955 3.39e-05 3.58e-05 1.09e-05 8.5e-06 2.4e-06 5.21e-06 2.26e-05 1.69e-06 1.6e-05 6.13e-06 1.5e-05 7.34e-06 2.69e-05 7.98e-06 6.33e-06 1.15e-05 2.25e-05 1.71e-05 4.18e-06 3.14e-06 9.31e-06 1.84e-05 1.72e-05 4.56e-06 2.73e-05 5.73e-06 7.68e-06 6.3e-06 1.93e-05 1.38e-05 8.7e-06 1.19e-06 1.3e-06 3.57e-06 5.21e-06 2.82e-06 2.98e-06 2.03e-06 2.25e-06 9.71e-07 8.74e-07 2.33e-05 4.68e-06 3.18e-07 1.07e-06 1.75e-06 3.27e-06 6.93e-07 4.65e-07
ENSG00000086015 MAST2 -368779 1.81e-06 4.86e-06 7.79e-07 2.43e-06 4.93e-07 8.22e-07 2.07e-06 1.59e-07 1.96e-06 7.14e-07 1.89e-06 1.2e-06 3.5e-06 2.04e-06 9.3e-07 1.65e-06 2e-06 2.75e-06 5.3e-07 6.52e-07 1.12e-06 2.24e-06 1.65e-06 9.56e-07 2.93e-06 9.36e-07 1.01e-06 1.04e-06 1.75e-06 1.39e-06 9.07e-07 3.82e-08 2.51e-07 1.28e-06 1.65e-06 6.12e-07 7.83e-07 1.69e-07 1.46e-07 2.51e-07 8.42e-08 2.48e-06 1.24e-07 1.74e-07 1.74e-07 3.08e-07 7.75e-07 1.11e-08 5.19e-08
ENSG00000117425 \N 574955 1.25e-06 2.53e-06 2.59e-07 1.42e-06 2.93e-07 4.46e-07 1.63e-06 5.78e-08 1.35e-06 3.05e-07 1.35e-06 5.75e-07 1.99e-06 8.7e-07 5.51e-07 8.28e-07 1.12e-06 1.3e-06 4.7e-07 1.89e-07 6.56e-07 1.2e-06 6.93e-07 5.75e-07 1.97e-06 2.4e-07 4.9e-07 4.96e-07 7.07e-07 8.56e-07 5.67e-07 3.9e-08 5.73e-08 5.87e-07 8.94e-07 3.05e-07 2.59e-07 6.89e-08 4.72e-08 5.72e-08 5.77e-08 1.34e-06 2.32e-08 2.65e-08 8.45e-08 7.77e-08 2.33e-07 1.91e-09 4.81e-08
ENSG00000117448 AKR1A1 -132335 1.11e-05 1.81e-05 5.5e-06 6.18e-06 2.04e-06 2.81e-06 1.18e-05 9.78e-07 1.03e-05 4.76e-06 9.08e-06 5.26e-06 1.7e-05 5.17e-06 5.09e-06 7.85e-06 9.2e-06 1.17e-05 2.97e-06 2.51e-06 6.56e-06 1.04e-05 8.99e-06 3.28e-06 1.48e-05 4.35e-06 4.74e-06 3.69e-06 1.2e-05 7.8e-06 4.53e-06 9.7e-07 9.28e-07 2.99e-06 2.96e-06 2.18e-06 2.34e-06 1.25e-06 1.09e-06 8.62e-07 4.03e-07 1.19e-05 2.66e-06 1.33e-07 6.87e-07 1.44e-06 1.98e-06 6.72e-07 5.96e-07
ENSG00000117481 NSUN4 -921969 6.33e-07 1.31e-06 1.22e-07 7.39e-07 1.18e-07 2.08e-07 6.19e-07 5.37e-08 4.26e-07 1.21e-07 6.56e-07 2.8e-07 7.36e-07 2.79e-07 1.68e-07 2.23e-07 7.72e-07 5.67e-07 1.62e-07 8.69e-08 2.52e-07 3.87e-07 2.81e-07 1.25e-07 6.59e-07 2e-07 1.74e-07 1.67e-07 1.98e-07 1.89e-07 3.38e-07 4.22e-08 3.96e-08 3.58e-07 5.49e-07 5.32e-08 6.67e-08 9.17e-08 6.57e-08 3.75e-08 3.92e-08 4.02e-07 5.24e-08 1.98e-08 3.41e-08 1.35e-08 1.11e-07 3.99e-09 4.73e-08
ENSG00000132773 TOE1 78156 3.08e-05 3.46e-05 1.04e-05 8.32e-06 2.34e-06 5.07e-06 2.18e-05 1.55e-06 1.54e-05 6.03e-06 1.41e-05 7.15e-06 2.57e-05 7.61e-06 6.24e-06 1.13e-05 2.12e-05 1.66e-05 4.15e-06 3.12e-06 9.08e-06 1.73e-05 1.64e-05 4.37e-06 2.66e-05 5.37e-06 7.57e-06 6.04e-06 1.83e-05 1.3e-05 8.36e-06 1.18e-06 1.23e-06 3.52e-06 4.96e-06 2.84e-06 2.93e-06 2.03e-06 2.16e-06 1.03e-06 8.4e-07 2.17e-05 4.6e-06 2.91e-07 9.58e-07 1.74e-06 3.18e-06 7.13e-07 4.83e-07
ENSG00000132780 NASP -165638 7.84e-06 1.28e-05 3.07e-06 5.03e-06 1.5e-06 1.56e-06 9.65e-06 8.73e-07 7.93e-06 3.57e-06 7.51e-06 3.71e-06 1.26e-05 4.11e-06 3.8e-06 6.33e-06 6.94e-06 9.12e-06 2.68e-06 1.4e-06 4.99e-06 7.98e-06 6.78e-06 2.85e-06 1.14e-05 2.92e-06 3.53e-06 2.47e-06 8.01e-06 6.83e-06 3.29e-06 9.88e-07 7.22e-07 2.78e-06 2.3e-06 1.7e-06 1.75e-06 4.36e-07 9.42e-07 7.13e-07 1.51e-07 8.09e-06 1.6e-06 1.69e-07 7.17e-07 9.55e-07 1.46e-06 2.26e-07 3.41e-07
ENSG00000132781 MUTYH 77738 3.12e-05 3.46e-05 1.04e-05 8.32e-06 2.38e-06 5.07e-06 2.18e-05 1.55e-06 1.54e-05 6.03e-06 1.41e-05 7.21e-06 2.57e-05 7.67e-06 6.24e-06 1.13e-05 2.14e-05 1.68e-05 4.15e-06 3.12e-06 9.08e-06 1.73e-05 1.64e-05 4.43e-06 2.66e-05 5.47e-06 7.57e-06 6.08e-06 1.83e-05 1.31e-05 8.36e-06 1.18e-06 1.25e-06 3.52e-06 5.01e-06 2.84e-06 2.93e-06 2e-06 2.19e-06 1.03e-06 8.13e-07 2.19e-05 4.58e-06 2.96e-07 9.58e-07 1.74e-06 3.21e-06 6.85e-07 4.95e-07
ENSG00000159588 CCDC17 -205849 5.28e-06 9.98e-06 2.32e-06 4.31e-06 1.51e-06 1.76e-06 8.6e-06 4.41e-07 4.91e-06 2.65e-06 5.26e-06 3.34e-06 1.02e-05 3.79e-06 2.17e-06 5.1e-06 4.74e-06 6.63e-06 1.63e-06 9.72e-07 3.16e-06 6.08e-06 4.76e-06 1.93e-06 8.59e-06 2.06e-06 2.45e-06 1.65e-06 5.55e-06 4.29e-06 2.85e-06 4.84e-07 6.31e-07 2.34e-06 2.03e-06 1.17e-06 1.86e-06 4.91e-07 1.26e-06 4.27e-07 3.53e-07 5.76e-06 9.02e-07 1.69e-07 4.86e-07 1.1e-06 9.55e-07 2.41e-07 2.1e-07
ENSG00000159592 GPBP1L1 -269905 4.03e-06 7.94e-06 1.17e-06 3.49e-06 8e-07 8.69e-07 4.23e-06 3.66e-07 4.96e-06 1.4e-06 3.2e-06 1.79e-06 7.27e-06 2.83e-06 1.21e-06 3.71e-06 3.78e-06 3.8e-06 1.37e-06 1.07e-06 2.91e-06 4.1e-06 3.45e-06 1.55e-06 4.86e-06 1.24e-06 1.53e-06 1.44e-06 3.77e-06 2.71e-06 1.98e-06 3.78e-07 5.85e-07 1.58e-06 2.16e-06 9.52e-07 1.07e-06 3.92e-07 5.34e-07 3.74e-07 2.86e-07 4.1e-06 4.44e-07 1.89e-07 3.22e-07 4.64e-07 9.64e-07 8.87e-08 1.09e-07
ENSG00000281912 LINC01144 114298 1.41e-05 2.3e-05 6.57e-06 6.74e-06 2.28e-06 3.93e-06 1.45e-05 1.18e-06 1.14e-05 5.11e-06 1.06e-05 5.88e-06 1.99e-05 5.8e-06 5.38e-06 9.01e-06 1.22e-05 1.26e-05 3.39e-06 2.8e-06 6.85e-06 1.22e-05 1.1e-05 3.4e-06 1.87e-05 4.58e-06 5.33e-06 4.59e-06 1.42e-05 8.81e-06 5.48e-06 1.08e-06 1.27e-06 3.1e-06 3.56e-06 2.53e-06 2.65e-06 1.84e-06 1.34e-06 9.64e-07 5.44e-07 1.39e-05 2.79e-06 1.97e-07 7.16e-07 1.64e-06 2.33e-06 6.21e-07 5.27e-07