Genes within 1Mb (chr1:45340534:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 1.37e-03 0.635 0.196 0.052 DC L1
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 7.24e-01 0.062 0.175 0.052 DC L1
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 4.93e-01 0.102 0.149 0.052 DC L1
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00121 0.176 0.052 DC L1
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 6.49e-01 0.0882 0.194 0.052 DC L1
ENSG00000117425 PTCH2 497281 sc-eQTL 2.29e-01 0.216 0.179 0.052 DC L1
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 3.37e-02 -0.36 0.168 0.052 DC L1
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 9.55e-02 0.232 0.139 0.052 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 6.12e-01 0.0947 0.186 0.052 DC L1
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0678 0.172 0.052 DC L1
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 2.21e-01 0.2 0.163 0.052 DC L1
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 2.34e-01 -0.233 0.195 0.052 DC L1
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0819 0.179 0.052 DC L1
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 3.26e-01 0.194 0.197 0.052 DC L1
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 8.06e-01 0.0386 0.157 0.052 DC L1
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 3.43e-01 0.181 0.191 0.052 DC L1
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 8.77e-02 0.174 0.101 0.052 DC L1
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 4.79e-01 0.135 0.19 0.052 DC L1
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 7.73e-03 -0.496 0.184 0.052 DC L1
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 1.33e-01 -0.15 0.0994 0.052 DC L1
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 9.66e-01 0.00573 0.135 0.052 DC L1
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 1.67e-01 0.231 0.166 0.052 DC L1
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 4.24e-01 -0.146 0.182 0.052 DC L1
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 2.34e-01 0.204 0.171 0.052 DC L1
ENSG00000222009 BTBD19 532052 sc-eQTL 5.38e-01 -0.124 0.202 0.052 DC L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 4.59e-01 0.168 0.226 0.051 B_Activated L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 3.59e-01 -0.203 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 1.98e-01 0.284 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 1.82e-03 0.605 0.191 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0492 0.239 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117425 PTCH2 497281 sc-eQTL 3.50e-01 -0.125 0.133 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0167 0.223 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 1.51e-01 -0.25 0.173 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 6.44e-01 0.103 0.224 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 6.04e-01 -0.12 0.231 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 5.14e-01 -0.127 0.195 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 4.25e-01 0.179 0.224 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 2.14e-01 0.27 0.216 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0123 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0228 0.217 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 3.81e-01 -0.202 0.229 0.051 B_Activated L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 4.08e-01 0.0953 0.115 0.051 B_Activated L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 3.05e-01 -0.239 0.232 0.051 B_Activated L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 1.66e-01 -0.294 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 4.08e-01 0.16 0.192 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 9.28e-02 0.351 0.208 0.051 B_Activated L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 1.38e-01 0.318 0.213 0.051 B_Activated L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 3.21e-01 -0.21 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0791 0.21 0.051 B_Activated L2
ENSG00000280670 CCDC163 -159545 sc-eQTL 4.85e-01 0.108 0.154 0.051 B_Activated L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 7.16e-01 0.072 0.197 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 3.26e-01 0.214 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 7.09e-01 0.0763 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0361 0.193 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 1.84e-01 0.289 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 5.80e-01 0.124 0.224 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 2.89e-01 0.174 0.163 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0662 0.202 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 2.16e-01 0.268 0.216 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 4.44e-01 0.16 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 5.47e-01 0.127 0.211 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 3.86e-01 -0.18 0.207 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0413 0.196 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 8.01e-01 0.0536 0.213 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0707 0.0886 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 5.23e-01 -0.132 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0207 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 34325 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0191 0.188 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 4.75e-01 -0.134 0.187 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 3.04e-01 0.161 0.156 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 9.14e-01 0.0189 0.176 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00918 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 7.82e-01 0.0445 0.161 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0463 0.213 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 8.99e-01 0.0278 0.218 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0911 0.208 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 1.47e-01 -0.295 0.203 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 4.29e-01 -0.176 0.222 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 5.54e-03 -0.566 0.202 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 5.09e-01 -0.102 0.155 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -792502 sc-eQTL 3.51e-01 0.165 0.176 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 3.52e-01 -0.2 0.215 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 2.48e-01 -0.244 0.211 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 5.36e-01 0.138 0.223 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 1.69e-01 -0.29 0.21 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 7.19e-02 -0.356 0.197 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 2.71e-01 0.189 0.171 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 8.75e-01 0.0359 0.227 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00313 0.112 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 1.68e-01 -0.282 0.204 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0228 0.217 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 34325 sc-eQTL 7.00e-01 0.0759 0.196 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 4.40e-01 0.148 0.191 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 3.84e-01 0.129 0.148 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 3.80e-01 0.163 0.185 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 8.75e-01 0.0334 0.213 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 5.49e-01 -0.107 0.178 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0614 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 2.28e-02 -0.455 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 1.77e-02 0.489 0.204 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 7.61e-01 0.0618 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 4.49e-01 0.171 0.225 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 3.29e-02 -0.432 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 2.20e-01 0.221 0.179 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -792502 sc-eQTL 9.67e-01 0.00784 0.189 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 3.59e-04 0.727 0.2 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 2.69e-01 0.22 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 3.31e-01 -0.2 0.205 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 5.29e-01 0.125 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0385 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 5.64e-01 0.0868 0.15 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 2.59e-01 0.235 0.208 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 1.92e-01 -0.155 0.119 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 3.46e-01 -0.203 0.215 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 9.51e-01 0.0111 0.179 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 34325 sc-eQTL 1.58e-01 -0.291 0.205 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 5.41e-02 -0.348 0.18 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 3.54e-01 0.13 0.14 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 9.91e-01 0.00229 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 5.30e-01 -0.132 0.21 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 2.08e-01 -0.238 0.188 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 3.91e-01 0.169 0.197 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 3.66e-02 0.438 0.208 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 4.17e-01 0.168 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0288 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 1.58e-01 0.299 0.211 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0671 0.192 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 5.40e-01 -0.112 0.183 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -792502 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0139 0.191 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 2.91e-01 -0.201 0.19 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 3.01e-01 -0.187 0.18 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 5.02e-01 -0.135 0.201 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 8.42e-01 0.0409 0.205 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 1.45e-01 0.289 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 7.55e-01 0.0591 0.189 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 1.02e-01 -0.294 0.179 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 4.06e-01 -0.185 0.222 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 2.13e-01 -0.122 0.0979 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 3.51e-01 -0.194 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0427 0.196 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 34325 sc-eQTL 7.66e-01 0.0535 0.18 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 5.25e-01 0.107 0.168 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 5.71e-01 -0.105 0.185 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 3.45e-01 -0.172 0.182 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 1.56e-02 -0.501 0.206 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 2.12e-01 -0.256 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 4.90e-01 0.146 0.211 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 7.07e-01 0.071 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 1.82e-01 0.281 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 9.22e-01 0.0209 0.214 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 6.64e-01 0.0924 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 6.05e-02 -0.34 0.18 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -792502 sc-eQTL 2.65e-01 0.224 0.201 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0619 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 7.95e-01 0.0554 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 4.39e-01 0.157 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 2.04e-01 0.286 0.225 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 3.16e-01 0.21 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00373 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0271 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 2.17e-01 -0.269 0.217 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 5.64e-02 -0.176 0.0915 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 9.47e-01 0.0125 0.19 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 4.70e-01 -0.149 0.206 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 34325 sc-eQTL 5.31e-01 0.118 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 4.36e-01 -0.146 0.187 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 8.55e-01 0.035 0.191 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 9.13e-01 0.0201 0.184 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 5.50e-01 -0.124 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 7.84e-03 0.514 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 1.48e-01 0.271 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 1.99e-01 0.253 0.196 0.056 cDC L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 7.38e-01 0.0587 0.175 0.056 cDC L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0573 0.204 0.056 cDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 497281 sc-eQTL 3.67e-01 0.152 0.168 0.056 cDC L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 2.67e-01 -0.208 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 8.57e-02 0.238 0.138 0.056 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 1.56e-01 -0.286 0.2 0.056 cDC L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 8.95e-01 0.0253 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 7.04e-01 0.0699 0.184 0.056 cDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 1.30e-01 -0.327 0.215 0.056 cDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 5.09e-01 -0.13 0.197 0.056 cDC L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 7.98e-01 0.0545 0.213 0.056 cDC L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 9.85e-02 0.318 0.192 0.056 cDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 8.01e-01 0.0501 0.198 0.056 cDC L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 3.18e-01 0.0914 0.0913 0.056 cDC L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0441 0.199 0.056 cDC L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 1.11e-01 -0.319 0.199 0.056 cDC L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0613 0.124 0.056 cDC L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 2.50e-01 0.154 0.133 0.056 cDC L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 8.58e-03 0.461 0.173 0.056 cDC L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 4.48e-02 -0.334 0.165 0.056 cDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 9.26e-01 0.0194 0.208 0.056 cDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 532052 sc-eQTL 6.94e-01 0.0732 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 2.72e-01 -0.219 0.199 0.051 intMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 7.43e-01 0.0695 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 3.26e-01 0.191 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 5.33e-02 -0.358 0.184 0.051 intMono L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0582 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 497281 sc-eQTL 4.15e-01 -0.14 0.172 0.051 intMono L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 9.20e-01 0.0195 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 4.91e-01 0.0806 0.117 0.051 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 4.21e-02 0.411 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 5.95e-01 -0.11 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 1.91e-01 -0.254 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 5.09e-01 0.134 0.203 0.051 intMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 3.31e-01 0.208 0.213 0.051 intMono L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 8.92e-01 -0.028 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 2.74e-01 -0.21 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 5.27e-01 0.117 0.185 0.051 intMono L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 2.43e-01 0.101 0.0866 0.051 intMono L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 7.63e-02 -0.371 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 1.35e-01 -0.294 0.196 0.051 intMono L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 3.04e-01 0.15 0.146 0.051 intMono L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 2.18e-02 -0.329 0.142 0.051 intMono L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 1.30e-01 0.276 0.182 0.051 intMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 8.38e-01 0.0432 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 532052 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0788 0.193 0.051 intMono L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0327 0.188 0.052 ncMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 8.30e-01 0.0389 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 4.26e-01 -0.149 0.187 0.052 ncMono L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 5.26e-01 -0.114 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 2.32e-02 -0.461 0.202 0.052 ncMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 497281 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00977 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0278 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 2.86e-01 0.168 0.157 0.052 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0662 0.206 0.052 ncMono L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 8.36e-01 -0.041 0.197 0.052 ncMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 3.19e-01 -0.203 0.203 0.052 ncMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 7.40e-01 0.0678 0.204 0.052 ncMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 7.69e-01 0.0626 0.213 0.052 ncMono L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 1.33e-01 -0.27 0.179 0.052 ncMono L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00475 0.173 0.052 ncMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 8.78e-01 0.0282 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 1.88e-01 0.105 0.0792 0.052 ncMono L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 5.67e-01 -0.104 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 4.01e-02 -0.396 0.191 0.052 ncMono L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00194 0.128 0.052 ncMono L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00657 0.126 0.052 ncMono L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 8.60e-01 0.0319 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0273 0.149 0.052 ncMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 532052 sc-eQTL 3.74e-03 -0.527 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000070759 TESK2 -150629 sc-eQTL 1.37e-01 0.33 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 353812 sc-eQTL 4.62e-01 0.168 0.229 0.051 pDC L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -879771 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0502 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000086015 MAST2 -446453 sc-eQTL 1.26e-01 -0.276 0.18 0.051 pDC L2
ENSG00000117419 ERI3 985274 sc-eQTL 8.09e-01 0.0527 0.218 0.051 pDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 497281 sc-eQTL 3.58e-01 -0.164 0.178 0.051 pDC L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 sc-eQTL 1.24e-01 -0.298 0.193 0.051 pDC L2
ENSG00000117450 PRDX1 -182513 sc-eQTL 1.92e-01 0.227 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 sc-eQTL 8.39e-01 0.0435 0.213 0.051 pDC L2
ENSG00000126088 UROD 329584 sc-eQTL 3.28e-01 -0.211 0.215 0.051 pDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 666053 sc-eQTL 1.67e-01 0.261 0.188 0.051 pDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 329210 sc-eQTL 2.63e-01 -0.252 0.224 0.051 pDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 -963074 sc-eQTL 5.87e-01 -0.123 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000132773 TOE1 482 sc-eQTL 8.17e-01 0.0528 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000132780 NASP -243312 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0263 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -359 sc-eQTL 6.37e-01 0.0938 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000142937 RPS8 565283 sc-eQTL 3.18e-01 0.128 0.128 0.051 pDC L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 sc-eQTL 1.08e-01 0.35 0.217 0.051 pDC L2
ENSG00000159596 TMEM69 -347647 sc-eQTL 1.25e-02 -0.51 0.202 0.051 pDC L2
ENSG00000173660 UQCRH -963164 sc-eQTL 7.67e-02 -0.308 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000173846 PLK3 540157 sc-eQTL 8.31e-01 0.037 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000187147 RNF220 935340 sc-eQTL 6.16e-01 0.104 0.208 0.051 pDC L2
ENSG00000197429 IPP -410119 sc-eQTL 2.76e-01 -0.225 0.205 0.051 pDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 665842 sc-eQTL 3.00e-01 0.208 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 532052 sc-eQTL 5.70e-01 -0.125 0.22 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070759 TESK2 -150629 eQTL 0.00155 0.108 0.0342 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000086015 MAST2 -446453 eQTL 5.33e-12 0.309 0.0442 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 eQTL 0.00959 -0.0671 0.0259 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 eQTL 2.15e-05 0.237 0.0555 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000126088 UROD 329584 pQTL 0.00782 0.0885 0.0332 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000132773 TOE1 482 eQTL 0.000781 -0.102 0.0303 0.00474 0.00375 0.0491
ENSG00000132780 NASP -243312 eQTL 6.27e-08 -0.199 0.0365 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000132781 MUTYH 64 eQTL 0.0135 0.0747 0.0302 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000159588 CCDC17 -283523 eQTL 1.52e-20 -0.297 0.0312 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 eQTL 0.0157 0.0594 0.0245 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000162415 ZSWIM5 34325 eQTL 0.045 -0.0967 0.0482 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000197429 IPP -410116 eQTL 0.00187 -0.145 0.0465 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000222009 BTBD19 532052 eQTL 0.036 -0.0709 0.0338 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000281912 LINC01144 36624 eQTL 0.00167 0.243 0.077 0.00118 0.0 0.0491


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000070759 TESK2 -150629 4.65e-06 5.32e-06 2.31e-06 3.2e-06 1.27e-06 1.6e-06 5.92e-06 9.12e-07 4.88e-06 2.86e-06 7.6e-06 3.31e-06 8.24e-06 2.07e-06 2.63e-06 3.71e-06 3.02e-06 2.38e-06 1.54e-06 1.12e-06 2.83e-06 5.44e-06 4.56e-06 1.4e-06 9.22e-06 2.19e-06 2.33e-06 1.78e-06 4.41e-06 4.67e-06 2.73e-06 4.91e-07 5.51e-07 2.6e-06 2.05e-06 1.16e-06 1.09e-06 4.93e-07 9.68e-07 8.87e-07 2.39e-07 8.33e-06 1.63e-06 2.2e-07 3.46e-07 1.06e-06 8.22e-07 2.72e-07 1.63e-07
ENSG00000086015 MAST2 -446453 4.37e-07 2.56e-07 3.43e-07 2.57e-07 1.05e-07 2.46e-07 4.53e-07 6.57e-08 2.81e-07 2.12e-07 5.73e-07 2.28e-07 7.93e-07 1.41e-07 4.17e-07 1.06e-07 7.3e-08 2.43e-07 1.7e-07 1.8e-07 1.68e-07 3.65e-07 2.33e-07 3.67e-08 6.02e-07 2.2e-07 2.24e-07 2.59e-07 2.19e-07 2.59e-07 2.31e-07 5.4e-08 5.07e-08 1.77e-07 2.55e-07 7.92e-08 1.31e-07 5.71e-08 5.62e-08 2.15e-08 3.68e-08 2.74e-07 6.17e-08 1.67e-07 3.61e-08 3.41e-08 1.11e-07 1.15e-08 5.54e-08
ENSG00000117425 \N 497281 3.21e-07 1.67e-07 2.7e-07 2.26e-07 1.08e-07 1.57e-07 3.33e-07 5.56e-08 2.01e-07 1.37e-07 3.25e-07 1.57e-07 5.39e-07 9.48e-08 2.96e-07 8.08e-08 4.45e-08 1.77e-07 9.69e-08 1.17e-07 1.34e-07 2.48e-07 1.81e-07 3.49e-08 3.27e-07 1.71e-07 1.57e-07 1.88e-07 1.48e-07 1.58e-07 1.71e-07 4.4e-08 4.27e-08 1.19e-07 1.22e-07 5.23e-08 1.18e-07 7.63e-08 4.99e-08 5.88e-08 5.1e-08 1.64e-07 5.54e-08 1.93e-07 2.64e-08 1.27e-08 1.22e-07 2.85e-09 4.68e-08
ENSG00000117448 AKR1A1 -210009 2.13e-06 2.63e-06 1.04e-06 1.74e-06 4.86e-07 8.89e-07 2.03e-06 4.25e-07 2.38e-06 1.2e-06 3.13e-06 1.37e-06 4.26e-06 1.2e-06 9.98e-07 1.19e-06 1.59e-06 1.16e-06 1.13e-06 1.21e-06 1.21e-06 3.19e-06 2.14e-06 9.14e-07 4.51e-06 1.09e-06 1.49e-06 1.71e-06 1.95e-06 1.83e-06 2.02e-06 2.55e-07 3.85e-07 1.8e-06 1e-06 9.73e-07 7.18e-07 3.68e-07 7.27e-07 3.45e-07 2.84e-07 3.42e-06 8.87e-07 1.9e-07 2.87e-07 3.52e-07 2.28e-07 2.63e-07 2.59e-07
ENSG00000117481 NSUN4 -999643 2.66e-07 1.08e-07 3.56e-08 1.7e-07 9.91e-08 9.32e-08 1.42e-07 5.24e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.53e-08 7.87e-08 5.12e-08 1.07e-07 5.2e-08 3.88e-08 1.06e-07 1.3e-07 1.29e-07 4.99e-08 1.29e-07 1.09e-07 1.1e-07 8.71e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.75e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.13e-08 3.97e-08 4.89e-08 9.2e-08 8.42e-08 3.07e-08 3.43e-08 1.37e-07 3.99e-08 1.99e-08 9.88e-08 1.69e-08 1.45e-07 4.33e-09 4.85e-08
ENSG00000132773 TOE1 482 9.85e-05 7.84e-05 1.32e-05 2.87e-05 1.27e-05 3.45e-05 9.47e-05 1.32e-05 8.33e-05 4.06e-05 0.000114 4.27e-05 0.000125 3.68e-05 1.55e-05 5.76e-05 4.39e-05 5.63e-05 1.78e-05 1.84e-05 3.58e-05 9.27e-05 7.54e-05 2.35e-05 0.000114 2.3e-05 3.69e-05 3.73e-05 7.42e-05 5e-05 5.54e-05 5.49e-06 8.82e-06 1.55e-05 2.38e-05 1.29e-05 6.88e-06 8.09e-06 1.28e-05 6.84e-06 3.25e-06 8.72e-05 9.66e-06 7.74e-07 7.02e-06 1.15e-05 1.07e-05 5.67e-06 4.22e-06
ENSG00000132780 NASP -243312 1.43e-06 1.66e-06 6.64e-07 1.28e-06 4.2e-07 7.89e-07 1.25e-06 3.9e-07 1.72e-06 7.42e-07 1.93e-06 1.15e-06 3.31e-06 1.24e-06 1.39e-06 9.54e-07 1.1e-06 7.21e-07 5.45e-07 6.87e-07 6.39e-07 2.07e-06 1.33e-06 5.41e-07 2.95e-06 1.01e-06 1.12e-06 1.45e-06 1.75e-06 1.39e-06 9.97e-07 2.06e-07 2.55e-07 1.24e-06 6.88e-07 6.66e-07 7.55e-07 2.23e-07 5.13e-07 3.79e-07 2.97e-07 2.5e-06 5.08e-07 1.73e-07 1.69e-07 3.24e-07 1.97e-07 1.39e-07 1.7e-07
ENSG00000132781 MUTYH 64 0.0004 0.000525 9.65e-05 0.000193 0.000186 0.000196 0.000488 0.000177 0.000534 0.000286 0.000607 0.000337 0.000699 0.000299 0.000142 0.000487 0.000234 0.000317 0.000182 0.000148 0.000334 0.000653 0.000376 0.000257 0.000604 0.000313 0.000411 0.000301 0.000418 0.000237 0.000343 9.07e-05 8.2e-05 0.00014 0.000141 0.000104 7.67e-05 6.62e-05 0.000138 9.29e-05 4.15e-05 0.000514 6.63e-05 7.56e-06 9.2e-05 0.000145 9.22e-05 8.16e-05 4.79e-05
ENSG00000159588 CCDC17 -283523 1.26e-06 9.73e-07 8.24e-07 8.58e-07 3.57e-07 6.46e-07 1.59e-06 3.49e-07 1.57e-06 6.07e-07 2.08e-06 6.62e-07 2.6e-06 4.19e-07 9.35e-07 7.17e-07 8.95e-07 5.72e-07 8.34e-07 5.08e-07 7.72e-07 1.91e-06 8.91e-07 5.76e-07 2.39e-06 6.42e-07 9.28e-07 8.53e-07 1.35e-06 1.34e-06 8.11e-07 4.91e-08 1.95e-07 6.13e-07 5.95e-07 4.91e-07 7.19e-07 1.55e-07 3.73e-07 2.25e-07 1.2e-07 1.52e-06 3.96e-07 1.44e-07 1.82e-07 3.44e-07 1.26e-07 5.32e-08 8.53e-08
ENSG00000159592 GPBP1L1 -347579 1.04e-06 7.58e-07 3.09e-07 4.43e-07 1.16e-07 4.57e-07 7.96e-07 1.45e-07 1.03e-06 3.24e-07 1.33e-06 5.28e-07 1.68e-06 2.54e-07 4.85e-07 2.89e-07 5.63e-07 4.2e-07 3.56e-07 6.44e-07 2.57e-07 9.57e-07 4.69e-07 1.91e-07 1.79e-06 2.4e-07 5.83e-07 7.22e-07 6.76e-07 8.5e-07 4.9e-07 6.31e-08 5.3e-08 6.53e-07 3.16e-07 3.38e-07 4.82e-07 1.11e-07 1.11e-07 2.42e-07 8.61e-08 8.79e-07 4.79e-07 1.64e-07 1.14e-07 1.27e-07 9.1e-08 8.41e-08 5.81e-08
ENSG00000281912 LINC01144 36624 3.27e-05 2.91e-05 5.11e-06 1.3e-05 3.5e-06 9.68e-06 3.35e-05 3.65e-06 2.31e-05 1.2e-05 3.16e-05 9.81e-06 3.92e-05 1.12e-05 6.2e-06 1.45e-05 1.17e-05 1.81e-05 6.02e-06 5.3e-06 1.16e-05 2.55e-05 2.47e-05 6.42e-06 3.59e-05 6.12e-06 1.05e-05 1.02e-05 2.59e-05 1.88e-05 1.7e-05 1.44e-06 2.07e-06 5.98e-06 9.11e-06 4.43e-06 2.29e-06 2.81e-06 3.62e-06 2.99e-06 1.48e-06 3.78e-05 3.24e-06 2.5e-07 1.98e-06 2.96e-06 3.21e-06 1.38e-06 1.32e-06